Material 32 3.3.7 Lösungen <strong>und</strong> Puffer für die PCR <strong>und</strong> die RT-PCR • 20 µl Ansatz: PCR-Reagenzien 10-fach Puffer + 25 mM MgCl 2 DNA-Polymerase (5 U/µl) dNTP-Mix (2 mM) ddH 2 O Primer, rückwärts (3 pmol/µl) Primer, vorwärts (3 pmol/µl) Menge 2 µl (2,5 mM MgCl 2 final) 0,1 µl (0,5 U final) 2 µl (0,2 mM final) abhängig <strong>von</strong> der DNA-Konzentration 2 µl (0,3 µM final) 2 µl (0,3 µM final) DNA-Vorlage konzentrationsabhängig; Ziel: 50-100 ng/20 µl • 20 µl Ansatz: RT-PCR-Reagenzien Menge ddH 2 O abhängig <strong>von</strong> der cDNA-Konzentration 2x Fast SYBR ® Green Master Mix 10 µl Primer, vorwärts (3 pmol/µl) 2 µl (0,3 µM final) Primer, rückwärts (3 pmol/µl) 2 µl (0,3 µM final) cDNA-Vorlage konzentrationsabhängig; Ziel: 20-50 ng/20 µl 3.3.8 Puffer für die Aufreinigung rekombinanter Proteine an einer FPLC • Lysepuffer Histidin-Fusionsproteine: 50 mM NaH 2 PO 4 , 300 mM NaCl, 10 mM Imidazol, 1 mg/ml Lysozym, Protease-Inhibitor, pH 7,5. • Waschpuffer Histidin-Fusionsproteine: 50 mM NaH 2 PO 4 , 300 mM NaCl, 20 mM Imidazol, pH 7,5. • Elutionspuffer Histidin-Fusionsproteine: 50 mM NaH 2 PO 4 , 300 mM NaCl, 250 mM Imidazol, pH 7,5. • Lysepuffer GST-Fusionsproteine: 140 mM NaCl, 2,7 mM KCl, 10 mM Na 2 HPO 4 , 1,8 mM KH 2 PO 4 , pH 7,0 (1-fach PBS). • Waschpuffer GST-Fusionsproteine: 1-fach PBS. • Elutionspuffer GST-Fusionsproteine: 50 mM Tris/HCl, 10 mM reduziertes Glutathion, pH 7,5. • PreScission-Proteasepuffer: 50 mM Tris/HCl, 150 mM NaCl, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, pH 7,0.
Material 33 • Proteinpuffer: A: 20 mM HEPES, 200 mM NaCl, pH 6,5 B: 20 mM HEPES, 200 mM NaCl, pH 7,0 C: 20 mM MES, 200 mM NaCl, pH 6,5 D: 20 mM Tris, 200 mM NaCl, pH 7,5
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