Estudos de relação estrutura atividade e docking - UFRJ

24No Verify 3D, a análise do modelo é feita através da determinação da compatibilidadedo modelo tridimensional em relação à própria sequência de aminoácidos do modelo avaliado(1D) atribuindo uma classe estrutural baseada na sua localização e ambiente (alfa, beta, alça,polar, não-polar, etc.) e comparando os resultados à estruturas satisfatórias. Uma coleção deestruturas é utilizada como referência para obter uma pontuação para cada um dos 20aminoácidos na sua classe estrutural. A janela de pontuação para cada aminoácido (de -10 até+10) é adicionada e plotada individualmente para cada resíduo e esta pontuação para serconsiderada ideal deve ser maior que 0,2 (BOWIE et al., 1991; LUTHY et al., 1992).4.2 RELAÇÃO ESTRUTURA ATIVIDADEAs séries de benzoxazinonas, 2-amino-benzoxazinona (12-20) e 2-oxi-benzoxazinona(21-29) (Tabela 1 e Tabela 2) sintetizadas previamente (JARVEST et al., 1996), foramcomparadas quanto aos valores de IC 50 baseando-se na presença do grupo amino- ou grupooxi-. Também foram feitas análises em relação aos substituintes das posições R 1 , R 2 , R 3 e R 4 ea correlação da presença ou ausência dos grupos presentes nestas posições e a atividade.