Estudos de relação estrutura atividade e docking - UFRJ

35Figura 17: Modelo da Protease de HSV-1 obtido através do programa MODELLER (amarelo)alinhado com a protease de HSV-2 (azul). Destaque em azul e verde escuros para a tríadecatalítica, composta pelos resíduos His61, Ser129 e His148.No intuito de avaliar a estrutura secundária obtida para o modelo da protease de HSV-1foi feita uma comparação com a protease de HSV-2, utilizada como molde na modelagemcomparativa. As estruturas secundárias das proteases foram geradas através do servidorPDBsum (LASKOWSKI et al., 1997; LASKOWSKI, 2001; LASKOWSKI et al., 2005;LASKOWSKI, 2009). De acordo com o resultado obtido, a estrutura secundária da proteasede HSV-1 possui 7 hélices α e 7 folhas β, também vistas na estrutura secundária da proteasede HSV-2 (Figura 18)