Estudos de relação estrutura atividade e docking - UFRJ

26Tabela 2: Valores de IC 50 para derivados da 2-oxi-benzoxazinona (21-29).R 2R 4ONOOR 3R 1Composto R 1 R 2 R 3 R 4 IC 50 (μM)21 Et H H H 2522 Et H H F 7523 Et NH2 H Me 1524 Et Cbz-Ala-NH H Cl 725 Et Cbz-Asn-NH H Et 2026 Et iBuCOONH Cl Cl 1,527 Alil H H H 1528 Ph H H H 1029 4-OCH 3 -Ph H H H 2,54.3 CONSTRUÇÃO DOS COMPOSTOSAs estruturas tridimensionais dos derivados de benzoxazinona (12-29, Tabelas 1 e 2)foram construídos no programa SPARTAN’10 (Wavefunction, Inc, CA) e geometricamenteminimizados com o campo de força MMFF (HALGREN, 1996). Em seguida foramsubmetidas à análise conformacional utilizando o método MMFF visando obter estruturasenergeticamente mais estáveis. Para obtenção das cargas eletrônicas, o melhor confôrmero decada inibidor foi otimizado utilizando o método semi-empírico RM1. Mais uma etapa paraobtenção das cargas eletrônicas foi realizada através de cálculos quânticos utilizando-se aTeoria do Funcional da Densidade (DFT/B3LYP/6-31G*) no programa SPARTAN’10. Emseguida, para obtenção das cargas atômicas, os arquivos obtidos foram salvos no formato*.mol2, selecionando a opção de carga eletrostática para os confôrmeros, que serão utilizadoscomo ponto de partida para o docking no sítio ativo da protease de HSV-1.