Estudos de relação estrutura atividade e docking - UFRJ

37(SWISS-MODEL Repository) e ModBase. Dentre estes, dois foram selecionados ecomparados com a estrutura terciária obtida através do programa MODELLER: SMR eModBase. Como o arquivo da estrutura terciária do modelo gerado através do ModBase nãose encontra disponível, um arquivo em formato *.PDB foi construído através das coordenadasdisponíveis no ModBase. As duas estruturas terciárias obtidas através do ModBase e SMRforam validadas utilizando o programa Procheck e Verify 3D.O resultado do gráfico de Ramachandran obtido para o modelo da literatura geradoatravés do ModBase (Figura 19) mostrou que 89,8% dos resíduos de aminoácidos encontramseem regiões permitidas e nenhum em regiões não permitidas. A análise pelo Verify 3D(Figura 20) mostrou que 81,03% dos resíduos tem valor de pontuação média 3D-1D maiorque 0,2.