Estudos de relação estrutura atividade e docking - UFRJ

40Figura 21: Gráfico de Ramachandran do modelo da protease de HSV-1 encontrado naliteratura gerado através do servidor SWISS MODEL Repository (SMR). Regiões maisfavoráveis (A,B,L -vermelho), Regiões adicionais permitidas (a,b,l,p - amarelo escuro),Regiões generosamente permitidas (~a, ~b, ~l, ~p - amarelo claro), Regiões não permitidas(branco). Regiões de hélice α (a, ~a ou A), Regiões de folha β (b, ~b, ou B), Regiões de héliceα de mão esquerda (l, ~l ou L), Regiões para Glicina (p ou ~p).Ao comparar os resultados de validação obtidos por modelos da literatura e o modeloobtido pelo programa MODELLER (Tabela 3), mais uma vez é possível justificar a escolhado modelo gerado pelo MODELLER para os estudos de docking molecular, sugerindo queeste modelo é mais preciso que os outros 2 obtidos da literatura e ainda, em relação ao modeloobtido através deste trabalho também pelo servidor SMR.