Estudos de relação estrutura atividade e docking - UFRJ

62interações dos ligantes volumosos. Sugere-se que a baixa atividade dos compostos 25 e 16,em relação aos cinco mais ativos, estejam relacionados ao volume das cadeias laterais.Apesar dos compostos 25 e 16 não exibirem o mesmo perfil de interações dos ligantesmais ativos, eles também interagem por ligações hidrogênio com outros resíduos. O resíduoLys133 interage com o oxigênio do grupamento carbonila do anel da benzoxazinona 25 comdistância de 2,7 Å, estabilizando o ligante na cavidade (Figura 37). Dados da literatura jáevidenciaram a ocorrência deste tipo de interação entre o ligante peptideomimético utilizadona etapa de validação de docking e a protease de CMV (KHAYAT et al., 2003). De acordocom o docking molecular desse composto, também pode ser observada uma interação do tipocátion-π, em uma distância de 3,3 Å com o anel aromático fenila da cadeia lateral do ligantecom o carbono polarizado do resíduo Arg157 presente na protease (Figura 37). Essa últimainteração pode desempenhar um papel importante na atividade (IC 50 = 20µM) desse ligante,uma vez que já foi discutida a importância desse resíduo para a atividade catalítica da proteasede HSV-1. A fenila da cadeia lateral do ligante ainda participa da interação hidrofóbica comos resíduos da cavidade hidrofóbica, contribuindo para a redução da energia livre de ligação.Figura 37: Representação do complexo obtido por docking molecular do composto 25(marrom) da série de benzoxazinonas. Em destaque, as ligações hidrogênio (em verde) docomposto 25 com resíduos da protease de HSV-1 (azul claro).O ligante 16, que também possui cadeia lateral volumosa, apresenta duas interaçõescom resíduos da protease de HSV-1 também observadas para o ligante 25, uma interação do