Estudos de relação estrutura atividade e docking - UFRJ

39Pontuações Modelo Modbase x 1AT30,90,80,70,60,50,40,30,20,10-0,1-0,2R V I V G L L D G S E A D D V A L P N L I V H A C V R L V D P G F V L A V L R L T A A I E R P L R E L Y I N L S S A K L G A P R L A V L A G R G I T D G D A A F H S A R G R L A A L L G T A G E L H L S A N M L D W L A R R A I G T L AAminoácidosModelo ModbaseFigura 20: Gráfico comparativo das pontuações obtidas através do Verify 3D do modelo daliteratura gerado através do programa Modbase (azul claro) e do modelo da protease de HSV-2, 1AT3 (Azul).1AT3Para o modelo gerado através do SMR o gráfico de Ramachandran (Figura 21) mostrouum valou de 83,7% de resíduos de aminoácidos em regiões permitidas e 1,5% em regiões nãopermitidas. A opção Verify 3D mostrou que 81,03% dos resíduos tem valor de pontuaçãomédia 3D-1D maior que 0,2.