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Estudos de relação estrutura atividade e docking - UFRJ

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48Tabela 5: Parâmetros <strong>de</strong> algoritmo genético utilizados no estudo <strong>de</strong> <strong>docking</strong> molecular noprograma AutoDock.Parâmetros algoritmo genéticoValoresPopulação inicial 150Número <strong>de</strong> avaliações 25000000Número <strong>de</strong> gerações 27000Elitismo 15Taxa <strong>de</strong> mutação 0,02Taxa <strong>de</strong> crossover 0,6Número <strong>de</strong> operações 100A escolha dos melhores parâmetros foi realizada através da avaliação dos arquivos <strong>de</strong>saída do programa AutoDock (*.dlg) utilizando-se os seguintes critérios: resultados comhistogramas com menor número <strong>de</strong> aglomerados (clusters) possíveis; resultados <strong>de</strong>histogramas em que o aglomerado mais populoso correspon<strong>de</strong> ao <strong>de</strong> menor energia;aglomerados com RMSD menor ou igual a 2. O melhor histograma obtido, consi<strong>de</strong>randoesses critérios, encontra-se ilustrado na Figura 26, cujos parâmetros utilizados foram os daTabela 5.Figura 26: Histograma obtido através do arquivo <strong>de</strong> saída do programa AutoDock.Aglomerado mais populoso correspon<strong>de</strong> ao <strong>de</strong> menor energia.

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