Estudos de relação estrutura atividade e docking - UFRJ

74Figura 47: Peptideomimético 0FP (31) complexado à protease de citomegalovírus e ligaçõeshidrogênio (rosa). Destaque para a ligação entre o oxigênio da carbonila amídica do ligante eo átomo de nitrogênio do resíduo ARG 137. Figura obtida através do programa LigandExplorer.De todas as benzoxazinonas a molécula 20 foi a menos ativa. Entretanto, como o valorde IC 50 não foi preciso (>300 µM), considerou-se a molécula 12 como a menos ativa dogrupo, cujo IC 50 é igual a 300 µM. A molécula 12 também foi avaliada no estudo de dockingmolecular, (Figura 48). De acordo com os resultados obtidos, o confôrmero selecionado nãointerage por nenhuma ligação hidrogênio com nenhum resíduo da cavidade de ligação. Apesardessa evidência, é possível observar interações hidrofóbicas entre o substituinte R 1 e osresíduos localizados nas vizinhanças de característica hidrofóbica (Leu27, Ala28, Leu38,Ala39, Val28, Leu130, Ala131, Ala150, Leu151, Ile154, Gly155, Leu158 e Gly159). Estasinterações foram observadas na maior parte das benzoxazinonas e parecem contribuir paraestabilização do ligante na cavidade do receptor. Sendo assim, a baixa atividade do composto12 pode estar associada com a ausência de ligações hidrogênio com resíduos importantes paraa atividade da protease, localizados na cavidade. Ainda que se observem a ocorrência deinterações hidrofóbicas que contribuem para a estabilização do ligante na cavidade, estasparecem não ser cruciais para aumentar a potência dos compostos.