Estudos de relação estrutura atividade e docking - UFRJ

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Figura 39: Docking molecular das moléculas 23 (roxo), 27 (amarelo), 21 (azul escuro) dasérie de benzoxazinonas e ligações hidrogênio (verde) com resíduos da protease de HSV-1(azul claro). À direita, posicionamento dos compostos 23, 27 e 21 na superfície da protease deHSV-1.65
66O docking molecular do composto 13 evidencia a importância da interação hidrofóbicanesta região novamente pela orientação do anel aromático no sentido da cavidade hidrofóbica.Apesar deste composto ser pouco volumoso, a cadeia principal orienta-se em direção opostaaos outros ligantes de atividade média e pouco volumosos, realizando uma ligação hidrogênioentre o oxigênio da carbonila presente no anel da benzoxazinona e o resíduo Thr132 comdistância de 2,9 Å e uma interação do tipo cátion-π (distância de 3,4 Å) entre o anel aromáticoda cadeia principal e o átomo de carbono polarizado presente no resíduo Arg157 (Figura 40).Esta última interação parece contribuir para a atividade (IC 50 =25 µM) desse composto, sendouma interação de caráter fraco apesar da importância do resíduo.Figura 40: Composto 13 (verde) na superfície da protease de HSV-1 após docking molecular(acima). Docking molecular da molécula 13 da série de benzoxazinonas e ligações hidrogênio(verde) com resíduos da protease de HSV-1 (azul claro) (abaixo).
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