lie^x - RUC

More documents

Recommendations

Info

Análisis de la ea^presión de 103 ORFs de función desconocida en S. cerevisiae Tabla 4.16. Recopilación de las localizaciones de los sitios de unión para los factores de regulación transcripcional de genes funcionalmente conocidos de S. cerevisiae. El área sombreada señala la zona preferencial elegida para la unión del factor considerado. E.C.: Estimador de confianza (Continuación). FACTOR GEN REFERENCIA E.C. POSICIÓN SOD2 ^attery O'Brien et al., 1997 4 -178, -138 TPS2 1 -523,-490,-441,-421,-308 DDR2 1 -472-248-203-175 CCTl 1 -330,-345,-100 STRE SSA1 ENA1 HSP26 Mager y De Kruijff, 1995 4 4 4 -211,-160 -651 -659, -484, -466, -328 HSP104 4 -252, -220, -172 UBI4 4 -655, -252 HALI 4 -399 800 700 600 500 400 300 200 100 Cada gen está acompañado de un estimador de la confianza que puede presentar en cuanto a la validez funcional del sitio de unión para un factor transcripcional determinado; éste toma los valores siguientes: 1- Para los sitios de unión a un factor confinnados funcionalmente (principalmente por Foot printing). 2- Para los sitios que unen factores transcripcionales en experimentos de unión DNA-proteína (Binding). 3- Para los genes cuya respuesta fisiológica varia cuando se les muta el sitio de unión al factor transcripcional implicado en dicha respuesta. 4- Para los genes que muestran, a la vez, una respuesta fisiológica determinada y secuencias consenso para la unión de un factor transcripcional relacionado con esa respuesta. Para los sitios de unión a los factores GATA, se indican en la tabla la localización del principio de la doble secuencia (T/A)GAT(T/A)(T/G), así 160 s^ T C:
• • • RESULTADOS Y DISCUSIÓN como el níunero de secuencias estabilizadoras de la unión de estos factores y que °están formadas tanto por la secuencia (T/A)GAT(T/A)(T/G) como por (T/A)GAT respectivamente. Para analizar los promotores de las ORFs que presentaron algún tipo de regulación en este trabajo, se estableció un valor "estimador" de la calidad de cada sitio potencial, resultado del producto entre la valoración de la idoneidad de su localización en el promotor y de su homología con una hipotética secuencia consenso de unión al factor. La calificación o valoración de estos sitios potenciales se realizó mediante una factorización basada en los criterios que se recogen en la tabla 4.17. Tabla 4.17. Método de valoración de los sitios de unión a factores transcripcionales encontrados en los promotores de las ORFs analizadas. 1 ^ . r ^ - • • ' ^ Ub^caĉion dentro del ^'^ ::promotor ^ Homología Cotl la secuencia consenso FACTOR 1,00 0.75 0.50 ^: Co^nc^de déntro de la , - : Éstá fuera de la véntana ^ ^ ' a t ^^ ^ ^r Está'alejadá en más dé: ventañá dehmitada para los ^ pero^dentró de un^margen 50 pb de la ventái^a geneŝ del ĝrúpo modelo dé +/ 5 ^ r ` , t_; Homología > 90% 90% > Homología > 80% Homología < 80% En el caso de los factores GATA se valoraron también las secuencias esparcidas en el promotor y que estabilizan la unión del factor a su sitio; para cada secuencia (T/A)GAT(T/A)(A/G) encontrada se le fijó un factor arbitrario de 0,2, mientras que para las secuencias (T/A)GAT, de menor "peso", de 0,1. 161
Page 2 and 3:
• • El presente trabajo: Análi
Page 4 and 5:
* • Por las numerosas imperfeccio
Page 6 and 7:
• • • ^ 1. INTRODUCCIÓN ÍND
Page 8 and 9:
• • • ^ 4.4.1.2. ORFs para la
Page 10 and 11:
• • • • A6^: absorbancia a
Page 12 and 13:
• •
Page 14 and 15:
Análisis de la expresión de 103 O
Page 16 and 17:
Page 18 and 19:
Page 20 and 21:
Page 22 and 23:
Page 24 and 25:
Page 26 and 27:
Page 28 and 29:
Page 30 and 31:
Page 32 and 33:
Page 34 and 35:
Page 36 and 37:
• • •
Page 38 and 39:
•
Page 41 and 42:
3. MATERIALES Y MÉTODOS
Page 43 and 44:
• • 3.1. Ceaas celulares: 3.1.1
Page 45 and 46:
• MATERIALES Y MÉTODOS El YNB (Y
Page 47 and 48:
• • • • MATERIALES Y MÉTOD
Page 49 and 50:
• 3.3. Extracción del RNA: 3.3.1
Page 51 and 52:
• • MATERIALES Y MÉTODOS d) Pa
Page 53 and 54:
• • MATERIALES Y MÉTODOS mezcl
Page 55:
• • MATERIALES Y MÉTODOS para
Page 58 and 59:
No G^, Análisis de la expresión d
Page 60 and 61:
Page 62 and 63:
Page 64 and 65:
Page 66 and 67:
Page 68 and 69:
Page 70 and 71:
Page 72 and 73:
Page 74 and 75:
Page 76 and 77:
Análisis de la expresibn de 103 OR
Page 78 and 79:
Page 80 and 81:
Page 82 and 83:
Page 84 and 85:
•
Page 86 and 87:
• • •
Page 88 and 89:
Page 90 and 91:
Page 92 and 93:
Page 94 and 95:
Page 96 and 97:
Page 98 and 99:
Page 100 and 101:
Page 102 and 103:
Page 104 and 105:
Page 106 and 107:
Page 108 and 109:
Page 110 and 111:
Page 112 and 113:
Page 114 and 115:
Page 116 and 117:
Page 118 and 119:
Page 120 and 121: Análisis de la expresión de 103 O
Page 142 and 143: Análisis de la e^resión de 103 OR
Page 148 and 149: ,oa Densidad génica ^ (%1 u Análi
Page 174 and 175: ' ín ^ W í^ ín C^ í íC^ C^ í
Page 176 and 177: O O ^--i O O N e O >^ M ^ ^r^-^ a o
Page 178 and 179: ^ 0 o r, ó '-^' N O OM 0 ^ ^ ^ ^ ^
Page 190 and 191: • •
Page 194 and 195: • • • ^
Page 210 and 211: Análisis de la exQresión de 103 O
Page 212 and 213: • •
Page 214 and 215: 5 °' ^ ^ o b ó ^ ^ ó Ú ^ «S o
Page 216 and 217: C_^ ^ •v O ^ ' cá ó. ^ ^ ^ ĉ ^
Page 218 and 219: ^ 0 ^ ^ 0 ^ -^ -v =^ ^ ^ ^v -v > ^
Page 220 and 221:
H ^ ^ ^ ^ ^ C". o .a ^ O ^ Ú ^ «3
Page 222 and 223:
Fi ra portada: Representación esqu
show all

lie^x - RUC

You also want an ePaper? Increase the reach of your titles

Delete template?

Save as template?