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Análisis de la expresión de 103 ORFs de función desconocida en S cerevisiae
cuya homología y posición no superaron los criterios de selección
predeterminados.
Resulta evidente que el análisis "in silico" de promotores puede resultar
una herramienta eficaz para la asignación de funciones a ORFs desconocidas,
sin embargo será necesario automatizar y complicar los algoritmos de
búsqueda a fin de que tengan en cuenta, no sólo la homología de la secuencia
respecto a un consenso y su posición en la secuencia lineal del promotor, sino
también su localización en la estructura tridimensional del promotor, su
interferencia con sitios de posicionamiento de nucleosomas o interrelaciones
multi-factoriales.
4.7. Re^ulación de la expresión ^énica en mutantes hanl, roxl v roxó:
Dado el interés de nuestro laboratorio en el estudio de la expresión de
genes aerobios e hipóxicos en la levadura S. cerevisiae, decidimos aprovechar
las circunstancias de este estudio sistemático de ORFs de función desconocida
para localizar algunos genes implicados en estas vías. Contabamos con la
disponibilidad de cepas mutadas en diversos genes reguladores.
Rencientemente se ha demostrado (Bécam et al., 1998) que una
mutación natural afectaba el gen regulador HAPI en algunas cepas de
S. cerevisiae utilizadas para el análisis funcional. El análisis de su secuencia
nucleotídica mostró que esta mutación consiste en la inserción de un elemento
Ty modificado en la región 3' de HAPI en la cepa FY1679 que deriva de la
cepa FY73 utilizada en este trabajo. Esta inserción podria afectar la
transcripción de HAPI debido a la formación de un transcrito híbrido inestable,
pero también a la actividad de la proteína resultante al modificar la región
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