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RESULTADOS Y DISCUSIÓN
como el níunero de secuencias estabilizadoras de la unión de estos factores y
que °están formadas tanto por la secuencia (T/A)GAT(T/A)(T/G) como por
(T/A)GAT respectivamente.
Para analizar los promotores de las ORFs que presentaron algún tipo de
regulación en este trabajo, se estableció un valor "estimador" de la calidad de
cada sitio potencial, resultado del producto entre la valoración de la idoneidad
de su localización en el promotor y de su homología con una hipotética
secuencia consenso de unión al factor. La calificación o valoración de estos
sitios potenciales se realizó mediante una factorización basada en los criterios
que se recogen en la tabla 4.17.
Tabla 4.17. Método de valoración de los sitios de unión a factores transcripcionales
encontrados en los promotores de las ORFs analizadas.
1 ^ . r ^ - • • ' ^
Ub^caĉion dentro del
^'^
::promotor ^
Homología Cotl la
secuencia consenso
FACTOR
1,00 0.75 0.50
^: Co^nc^de déntro de la
, -
: Éstá fuera de la véntana ^
^ ' a t ^^ ^
^r
Está'alejadá en más dé:
ventañá dehmitada para los ^ pero^dentró de un^margen
50 pb de la ventái^a
geneŝ del ĝrúpo modelo dé +/ 5 ^ r ` , t_;
Homología > 90% 90% > Homología > 80% Homología < 80%
En el caso de los factores GATA se valoraron también las secuencias
esparcidas en el promotor y que estabilizan la unión del factor a su sitio; para
cada secuencia (T/A)GAT(T/A)(A/G) encontrada se le fijó un factor arbitrario
de 0,2, mientras que para las secuencias (T/A)GAT, de menor "peso", de 0,1.
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