lie^x - RUC

Análisis de la expresión de 103 ORFs de función desconocida en S cerevisiae
comparándolos con el nivel de mRNA de ACTI observado durante el
crecimiento exponencial en glucosa (condición 2) usando la relación:
N.A. (unidades arbitrarias) = A.E.ACT^ x N.R.ACTImax
A.E.oit^
Donde A.E. es la actividad específica de cada sonda utilizada (ver
apartado 3.6.2.) y N.R.ACTImax el nivel relativo máximo de uria ORF cuando
se compara al nivel de expresión de ACTI en YPD.
El nivel absoluto de mRNA calculado por el procedimiento descrito nos
permitió clasificar las ORFs por su tasa de expresión:
Alta expresión: N.A. > _ 0.5
Mediana expresión: - 0.1 < N.Á. < 0.5
Baja expresión: N.A. < 0.1
No detectable: ausencia de señal.
3.8. Búsgueda de características deducidas de las secuencias de ADN:
3.8.1. Determinación del uso de codones:
La desviación en el uso de codones se cuantificó mediante el cálculo
del CAI (Codon Adaptation Index) propuesto por Sharp y Li (1987).
El CAI está basado en la determinación de un valor w para cada codon
de la ORF y representa la frecuencia relativa de uso del codon, utilizando
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