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Análisis de la expresión de 103 ORFs de función desconocida en S. cerevisiae
Cuando se consideran únicamente aquellos sitios que cumplen las
restricciones impuestas respecto a su número y localización en el promotor, el
porcentaje de concordancia con el tipo de regulación observado mejora sólo
muy levemente y en el caso de algunos factores como Gcrlp, Hsfp o los
elementos STRE, incluso disminuye. Este resultado puede estar motivado por
diversos hechos. Por una parte, se sabe que hay una distribución aleatoria de
secuencias coincidentes con sitios de reconocimiento y que contribuiría a la
aparición de falsos positivos (Schuldiner et al., 1997). Por otra parte, la
estructura de los promotores es muy compleja y la regulación final no es
dependiente de un único factor sino de interacciones sinérgicas o antagónicas
de varios sucesos reguladores.
En los últimos años se han realizado varias aproacirriaciones para
determinar la función de nuevos genes a partir de secuencias promotoras
conocidas por su participación en procesos de regulación. En este sentido cabe
destacar el trabajo realizado por Fondrat y Kalogeropoulos en el cromosoma
III (Fondrat y Kalogeropoulos, 1996) o el más reciente de Sculdiner et al.,
sobre la totalidad del genoma (Schuldiner et al., 1997). A1 comparar sus
resultados con los encontrados en nuestro trabajo, sólo podemos hacer
referencia a las conclusiones sobre GCN4 ya que fue el único analizado por
Schuldiner et al., y el único en común respecto al trabajo de Fondrat y
Kalogeropoulos.
Estos últimos autores, utilizando condiciones altamente restrictivas para
la localización de sitios GCN4, identificaron 7 sitios en las regiones
correspondientes a ORFs de función desconocida del cromosoma III y que
asciende a un número de 76. ^De estas siete, tres fueron descartadas por
coincidir dentro de las regiones codificadoras y otras tres por quedar fuera del
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