Untersuchung von Cyclodextrinkomplexen - OPUS - Universität ...

Ergebnisse und Diskussion
bei der Betrachtung der energetischen Ergebnisse der Dockingstudien ohnehin einige
Einschränkungen vorwegschicken. Die Ergebnisse der einzelnen Dockingläufe liegen sehr
nahe beieinander. Teilweise liegt die Standardabweichung der Parametrisierung des
Programms höher als die Differenz einzelner Werte untereinander. Es ist in einem solchen
Fall eigentlich nicht möglich, die eine oder die andere Struktur zur günstigsten zu
bestimmen. Es wäre sinnvoll, eine alternative, auf Cyclodextrine abgestimmte
Scoringfunktion anzuwenden. Auf eine solche Erweiterung der Versuche wurde aus
Zeitgründen allerdings verzichtet. Die erhaltenen Werte für EFB können als relativer
Bezugspunkt bei der weiteren Auswertung gesehen werden. Sie stellen aber definitiv keine
thermodynamische Größe für die Komplexbildung dar.
Der Vergleich der EFBmin aus den zehn Dockingversuchen für jedes Gastmolekül sollte
zeigen, mit welchem der Cyclodextrinkonformere die stabilsten Komplexe gebildet werden
können. In Abbildung 5.35 sind die erhaltenen EFBmin für die einzelnen Arzneistoffe in ihrer
ungeladenen Form dargestellt.
EFBmin [kJ/mol]
-20
-24
-28
-32
-36
SDZ
SDD
SFZ
SGD
SMR
Die Kurven für die einzelnen Cyclodextrine zeichnen sich durch einen ähnlichen Verlauf aus.
Für jeden Arzneistoff liegen die Werte jeweils in einer Spanne von etwa 5 kJ/mol. Die Lage
dieses Wertebereichs wird durch den Gast vorgegeben. Beispielsweise liegen alle Werte für
Sulfanilamid (SNA) höher als jene für Sulfamethoxazol (SMZ). Aber auch die Form des
Cyclodextrins hat Einfluss auf die berechnete freie Energie. Zwischen den einzelnen
Cyclodextrinkonformeren liegen deutliche Unterschiede in EFBmin für den jeweiligen
Arzneistoff vor. Wäre für alle Sulfonamidmoleküle dieselbe Cyclodextrinkonformation am
günstigsten, so müsste sich ein paralleler Kurvenverlauf ergeben, bei dem immer dasselbe
Cyclodextrin die niedrigste EFBmin erzielen würde. Die Kurven schneiden sich aber mehrfach
SMT
Gastmolekül
SMZ
SNA
Abb. 5.35: EFBmin als Dockingergebnis für die ungeladenen Arzneistoffe
STZ
CD 1
CD 2
CD 3
CD 4
CD 5
CD 6
CD 7
C D8
CD 9
CD 10
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