Enzkin - Elm-Asse-Kultur
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Km/Ki<br />
8.6 Parametervergleich: Bindungsmessungen und Enzymkinetik<br />
8.7<br />
Messung im thermodynamischen kinetische Messung<br />
Gleichgewicht (Bindungsmessung) (Enzymkinetik)<br />
r, Zahl besetzter Bindungsplätze v, Umsatzgeschwindigkeit<br />
n, Zahl vorhandener Bindungsplätze V max , maximale Umsatzgeschwindigkeit<br />
K d , Dissoziationskonstante [mol/l] K m , Michaeliskonstante [mol/l]<br />
L, Konzentration an freiem Liganden S, Substratkonzentration<br />
Mit diesen Konversionen lassen sich alle Gleichungen/Auftragungen der<br />
Enzymkinetik für Protein Ligandenwechselwirkungen einsetzen und vice versa.<br />
8.7 Zur Auswertung emzymkinetischer Daten: Merkmale verschiedener Plots<br />
Hans Bisswanger, "Theorie und Methoden der Enzymkinetik", Verlag Chemie (1979<br />
8.7.1 Computergestützte Analyse<br />
Die Bestimmung der Parameter K m (K d ) und V max (n) aus hyperbolischen Sättigungsfunktionen<br />
erfolgt heute zweckmäßigerweise mit Computerunterstützung, d.h. durch<br />
nichtlineare Regressionsanalyse. Eine einfache Analyse dieses Typs findet sich in<br />
den Programmen "KmVm" und "MMenten"; sich überlagernde Hyperbeln können<br />
durch das höherentwickelte Programm "Composit" analysiert werden.<br />
8.7.2 Bedeutung konventioneller Auftragungen<br />
Zur Datenrepräsentation und für eine vorläufige graphische Analyse eignen sich<br />
lineare Transformationen der Michaelis-Menten Beziehung, wie sie unter 8.4<br />
abgeleitet wurden. Aufgrund unvermeidbarer Messfehler beinhalten alle diese<br />
graphischen Verfahren bei der Auswertung einiges an Subjektivität, was man sich<br />
am besten mit Hilfe der Graphikprogramme "Enzpack" oder "MMenten" 23<br />
veranschaulicht. Dort und bei Inspektion der Abbildung 8.6-a wird man folgendes<br />
feststellen:<br />
23 Abbildung 8.4 (umseitig): Möglichkeiten der Datentransformation und Datenausgabe im<br />
Programm "MMenten". Das Diagramm "V vs. S plot" zeigt die Messdaten (bei gleichbleibenden<br />
Konzentrationsunterschieden auf der S-Achse); die weiteren Diagramme zeigen Transformationen für<br />
diese Messpunkte, wie sie z.B. unter 'files' im Programmpaket beschrieben werden.