The effects of activated carbon and plants diversity ... - 华南农业大学

华 南 农 业 大 学 农 学 院 第 三 届 综 述 大 赛 获 奖 作 品 论 文 集二 等 奖 作 品衡 分 布 的 ,566 个 基 因 组 区 域 具 有 很 高 的 多 态 位 点 分 布 , 其 全 长 为 48.6 Mb, 占 全 基 因 组的 13.6%, 而 还 有 64.7 Mb 的 区 域 是 含 籼 粳 多 态 位 点 很 低 的 区 域 , 占 全 基 因 组 的 18.1%,同 时 许 多 籼 粳 分 化 SNP 分 布 少 的 区 域 会 比 分 不 多 的 区 域 长 , 这 可 能 与 相 关 基 因 的 渗 入 有关 。6 展 望前 人 做 的 大 量 研 究 只 是 针 对 QTL 基 因 等 这 样 的 单 性 状 基 因 为 研 究 对 象 进 行 籼 粳 分 化的 研 究 , 不 能 够 从 全 基 因 组 整 体 的 水 平 来 把 握 、 研 究 栽 培 稻 的 籼 粳 分 化 。 随 着 第 二 代 高通 量 测 序 技 术 的 广 泛 应 用 , 多 品 种 的 全 基 因 组 重 测 序 已 成 为 可 能 , 这 位 从 全 基 因 组 序 列水 平 全 面 的 进 行 籼 粳 分 化 研 究 提 供 了 条 件 。 有 研 究 比 较 了 9311 和 日 本 晴 的 全 基 因 组 序 列 ,这 还 只 是 两 个 品 种 , 不 能 代 表 籼 稻 和 粳 稻 这 两 个 亚 种 的 分 化 差 异 , 但 是 这 个 研 究 为 我 们进 行 籼 粳 亚 种 间 多 品 种 分 化 研 究 指 出 了 方 向 。 在 两 个 参 考 序 列 的 比 较 结 果 中 , 具 有 大 量的 SNP 和 Indel 籼 粳 分 化 变 异 , 单 这 些 里 面 有 多 少 是 这 两 个 品 种 间 的 差 异 , 有 多 少 是 籼粳 亚 种 这 两 个 群 体 间 的 差 异 还 需 进 行 研 究 。 如 此 多 的 序 列 得 带 这 后 , 如 后 正 确 的 运 用 比较 基 因 组 学 和 生 物 信 息 学 的 方 法 来 进 行 数 据 处 理 , 也 还 需 进 行 探 索 。籼 粳 分 化 研 究 的 侧 重 点 , 一 直 以 来 对 籼 粳 分 化 的 研 究 主 要 集 中 在 杂 种 育 性 方 面 , 大量 的 定 位 了 籼 粳 亚 种 不 育 的 QTL, 这 是 趋 于 为 了 提 高 水 稻 的 产 量 这 个 目 的 , 但 是 籼 粳 亚种 杂 种 的 缺 陷 还 有 植 株 过 高 和 生 育 期 长 等 , 这 些 方 面 的 籼 粳 分 化 研 究 需 要 加 强 , 更 需 要在 全 基 因 组 的 水 平 上 对 籼 粳 分 化 进 行 研 究 。亚 洲 栽 培 稻 现 在 已 经 成 为 植 物 基 因 组 学 研 究 中 的 一 个 重 要 的 模 式 植 物 , 它 的 起 源 和遗 传 分 化 问 题 一 吸 引 着 众 多 进 化 生 物 学 家 、 遗 传 学 家 和 育 种 学 家 的 不 断 研 究 。 栽 培 稻 的起 源 一 直 是 水 稻 研 究 中 一 个 争 论 较 大 的 问 题 , 由 于 研 究 信 息 的 不 全 面 , 提 出 的 集 中 起 源的 观 点 也 都 没 有 得 到 充 分 的 证 实 。 因 此 , 在 大 量 基 因 组 序 列 得 到 的 基 础 上 , 通 过 怎 样 的方 法 从 如 此 多 的 信 息 中 提 炼 出 真 正 的 籼 粳 分 化 的 信 息 , 为 栽 培 稻 的 起 源 提 供 充 足 的 证 据也 是 一 个 重 点 。随 着 进 行 籼 粳 分 化 研 究 的 标 记 信 息 越 来 越 多 , 出 现 了 一 个 新 的 问 题 就 是 怎 样 界 定 籼稻 和 粳 稻 。 在 表 型 是 研 究 籼 粳 分 化 时 , 可 能 大 部 分 都 能 明 显 的 归 为 籼 稻 或 粳 稻 , 但 在 全基 因 组 序 列 的 水 平 上 , 随 着 品 种 的 增 加 , 籼 稻 与 粳 稻 的 差 异 是 成 连 续 排 列 的 。 因 此 , 在全 基 因 组 籼 粳 分 化 标 记 的 前 提 下 , 以 一 个 什 么 标 准 来 界 定 籼 稻 和 粳 稻 , 是 接 下 来 进 行 籼粳 分 化 研 究 首 先 要 解 决 的 问 题 。参 考 文 献丁 颖 . 中 国 栽 培 稻 种 的 分 类 . 见 : 丁 颖 . 丁 颖 稻 作 论 集 . 北 京 : 中 国 农 业 出 版 社 , 1983, 74-93王 象 坤 , 程 侃 声 . 亚 洲 栽 培 稻 起 源 、 演 化 中 两 个 重 要 稻 种 类 型 的 研 究 . 遗 传 学 报 , 1987,14(4):262-270包 灵 丰 , 林 刚 , 赵 德 明 等 . 运 用 程 氏 指 数 法 对 恢 复 系 宜 恢 3551 籼 粳 属 性 的 鉴 . 杂 交 水 稻 ,150