The effects of activated carbon and plants diversity ... - 华南农业大学

华 南 农 业 大 学 农 学 院 第 三 届 综 述 大 赛 获 奖 作 品 论 文 集三 等 奖 作 品鉴 于 InDel 标 记 的 多 态 性 比 SSR 标 记 要 小 , 带 型 简 单 , 分 布 较 密 , 用 于 遗 传 分 析 或基 因 诊 断 的 重 现 性 、 准 确 性 和 分 辨 率 大 大 提 高 , 非 常 适 合 于 构 建 高 密 度 的 遗 传 图 谱 和 基因 定 位 分 析 ( 闫 双 勇 ,2005; 余 庆 波 ,2005)。 由 InDel 标 记 衍 生 而 来 的 内 含 子 长 度 多态 性 标 记 (Wang,et al, 2005; 卢 泳 全 ,2006) 在 基 因 精 细 定 位 和 禾 本 科 基 因 组 比 较 研 究 中将 具 有 非 常 广 泛 的 应 用 。 此 外 ,InDel 标 记 在 染 色 体 步 移 等 多 个 研 究 领 域 都 显 示 出 广 阔 的研 究 前 景 (Ma,et al, 2005; Schnabel,et a1,2005)。有 人 认 为 , 籼 粳 差 异 的 产 生 涉 及 一 系 列 基 因 以 及 基 因 间 的 互 作 , 究 其 根 本 原 因 , 可能 是 基 因 组 DNA 序 列 发 生 了 改 变 , 包 括 DNA 重 排 、 碱 基 替 换 、 插 入 、 缺 失 、 易 位 、 倒位 和 重 复 序 列 变 异 等 ( 王 俊 等 ,2003)。 蔡 星 星 等 (2006) 通 过 对 93-11 和 日 本 晴 的 全 基因 组 序 列 比 较 分 析 , 发 现 它 们 存 在 大 量 DNA 的 InDel 片 段 , 而 这 些 差 异 通 过 本 实 验 所 利用 的 大 量 籼 稻 和 粳 稻 品 种 的 PCR 和 电 泳 分 析 得 到 了 验 证 , 表 明 这 些 InDel 片 段 不 仅 反 映了 93-11 和 日 本 晴 这 两 个 水 稻 品 种 之 间 的 差 异 , 而 且 在 一 定 程 度 上 反 映 了 籼 稻 与 粳 稻 这两 种 生 态 型 之 间 的 差 异 。因 此 , 基 于 籼 稻 93-11 和 粳 稻 日 本 晴 全 基 因 组 序 列 比 对 获 得 的 InDel 差 异 片 段 设 计 的引 物 可 以 用 于 栽 培 稻 籼 稻 和 粳 稻 品 种 的 鉴 定 以 及 籼 - 粳 分 化 问 题 的 研 究 , 及 探 索 稻 属 不 同物 种 间 的 亲 缘 关 系 。 王 明 军 等 (2010) 利 用 根 据 粳 稻 日 本 晴 和 籼 稻 93-11 基 组 序 列 设 计的 34 对 特 异 性 插 入 / 缺 失 引 物 , 结 果 表 明 , 云 南 糯 稻 籼 粳 分 化 明 显 。InDel 引 物 确 实 能 快 速 、 有 效 地 鉴 定 稻 属 品 种 的 籼 粳 性 , 还 可 计 算 出 每 个 测 试 品 种 的籼 粳 基 因 频 率 , 量 化 品 种 的 籼 粳 性 , 这 有 利 于 新 品 种 培 育 时 , 精 确 地 选 配 杂 交 组 合 的 亲本 , 提 高 育 种 速 度 和 效 率 , 缩 短 育 种 周 期 , 同 时 , 对 种 质 资 源 的 保 护 和 利 用 也 具 有 重 要的 作 用 和 意 义 。3.5 籼 粳 亚 种 在 细 胞 质 DNA 上 的 分 化籼 粳 亚 种 在 cpDNA 和 mtDNA 水 平 上 也 存 在 明 显 分 化 。Dally 等 (1990) 发 现 籼 粳亚 种 具 有 不 同 的 cpDNA 限 制 性 内 切 酶 模 型 , 且 大 多 数 来 自 中 国 的 普 通 野 生 稻 具 有 粳 稻 品种 的 叶 绿 体 型 。3.6 热 稳 定 蛋 白 与 水 稻 籼 粳 分 化 的 关 系付 深 造 (2010) 利 用 SDS-PAGE 对 40 个 栽 培 稻 品 种 的 热 稳 定 蛋 白 进 行 分 离 , 结 果 表明 , 品 种 之 间 存 在 着 热 稳 定 蛋 白 表 达 差 异 :10 个 典 型 粳 稻 品 种 都 含 有 特 异 蛋 白 条 带 BandⅠ(45.2Kda) 或 BandⅡ(46.5Kda); 而 10 个 典 型 籼 稻 品 种 都 未 检 测 到 这 两 个 条 带 这 表明 栽 培 稻 在 蛋 白 质 水 平 上 存 在 分 化 现 象 , 能 够 用 于 研 究 栽 培 稻 品 种 的 籼 粳 分 化 。 可 以 初步 以 BandⅠ 和 BandⅡ 作 为 标 志 带 来 研 究 籼 粳 分 化 和 鉴 别 栽 培 稻 , 含 有 BandⅠ 或 BandⅡ的 品 种 判 为 粳 稻 , 两 条 带 都 不 含 的 品 种 判 为 籼 稻 。4 总 结籼 粳 分 化 的 鉴 定 方 法 先 后 经 历 了 地 理 远 缘 和 形 态 性 状 标 记 、 生 态 标 记 、 分 子 标 记 等过 程 。 实 际 应 用 表 明 , 先 前 的 鉴 定 方 法 简 便 易 行 , 但 精 确 度 不 高 , 特 别 是 籼 粳 杂 交 后 代310