The effects of activated carbon and plants diversity ... - 华南农业大学

华 南 农 业 大 学 农 学 院 第 三 届 综 述 大 赛 获 奖 作 品 论 文 集二 等 奖 作 品Yamamoto T, Kuboki Y, Lin S Y et al. 1998 .Fine mapping of quantitative trait loci Hd-1, Hd-2and Hd-3, controlling heading date of rice, as single Mendelian factors. Theoretical andApplied Genetics, 97: 37-44.Zhang JL, Huang Y, Qiu LY et al. 2007.von Willebrand factor type C domain-containingproteins regulate bone morphogenetic protein signaling through different recognitionmechanisms. J Biol Chem, 282(27): 20002–20014.生 物 信 息 学 在 水 稻 基 因 组 学 中 的 应 用宋 彬华 南 农 业 大 学 农 学 院 2011 级 作 物 遗 传 育 种摘 要 : 生 物 信 息 学 是 计 算 机 科 学 与 生 物 学 的 交 叉 学 科 , 主 要 研 究 生 物 数 据 库 及 生 物 信 息分 析 , 在 水 稻 基 因 组 学 研 究 中 发 挥 着 重 要 的 作 用 。 本 文 概 述 了 生 物 信 息 学 和 基 因 组 学 的概 念 , 介 绍 了 国 际 水 稻 基 因 组 测 序 计 划 。 同 时 对 目 前 生 物 信 息 学 在 水 稻 基 因 组 学 研 究 中的 应 用 进 行 了 综 述 性 介 绍 , 主 要 内 容 包 括 生 物 信 息 数 据 库 的 特 点 与 分 类 、 国 内 外 的 水 稻生 物 信 息 数 据 库 、 序 列 比 对 的 基 本 思 想 和 主 要 方 法 、 序 列 拼 接 的 基 本 思 想 和 主 要 方 法 。此 外 , 还 总 结 了 当 前 生 物 信 息 学 应 用 中 存 在 的 问 题 , 展 望 了 其 发 展 和 应 用 前 景 。关 键 词 : 生 物 信 息 学 基 因 组 学 水 稻 数 据 库 序 列 比 对 序 列 拼 接Bioinformatics and Its Application in Rice Genomics ResearchAbstract: Bioinformatics is a cross subject between computer science and biology, whichplays an important role in rice genomics research, the primary content of which containsbiological database and biological information analysis. This paper summarizes the concept ofbioinformatics and genomics, introduced the International Rice Genome Sequencing Project(IRGSP). At the same time, the application of bioinformatics in the rice genome research isreviewed, including: The characteristics and classifications of bioinformatics database, thedomestic and overseas bioinformatics database of rice, the basic ideas and main method of thesequence alignment and sequence splicing. Furthermore, the problem and prospect ofbioinformatics are discussed.Key Words: Bioinformatics Genomics Rice Database Sequence alignment Sequencesplicing162