华 南 农 业 大 学 农 学 院 第 三 届 综 述 大 赛 获 奖 作 品 论 文 集一 等 奖 作 品难 。2 逆 境 胁 迫 下 植 物 基 因 组 DNA 甲 基 化 修 饰在 胁 迫 条 件 下 ,DNA 甲 基 化 具 有 调 节 植 物 胁 迫 响 应 基 因 的 表 达 和 生 长 发 育 的 能 力[22]。 当 胁 迫 响 应 基 因 处 于 表 达 状 态 时 甲 基 化 水 平 往 往 很 低 , 当 胁 迫 结 束 时 随 着 生 长 发 育的 需 要 将 该 基 因 关 闭 , 就 会 在 该 基 因 的 启 动 子 或 编 码 区 发 生 重 新 甲 基 化 , 使 基 因 转 录 受到 抑 制 , 基 因 失 活 , 从 而 终 止 其 表 达 。 植 物 DNA 甲 基 化 对 不 同 逆 境 胁 迫 的 响 应 表 现 出 不同 的 水 平 。 直 到 现 在 , 胁 迫 的 发 现 和 特 异 序 列 DNA 甲 基 化 改 变 之 间 的 关 系 仍 然 处 于 理 论研 究 阶 段 。2.1 金 属 离 子 与 植 物 基 因 组 DNA 甲 基 化几 种 重 金 属 离 子 处 理 对 重 金 属 敏 感 的 三 叶 草 (Trifolium repens L.) 和 具 有 一 定 耐 受 能力 的 大 麻 (Cannabis sativa L.) 的 实 验 中 , 抗 5-mC 的 单 克 隆 抗 体 免 疫 标 记 分 析 未 处 理 的 三[23]叶 草 和 大 麻 , 发 现 后 者 比 前 者 表 现 出 更 高 的 DNA 甲 基 化 水 平 , 在 根 部 也 有 同 样 的 表 现 。推 测 出 更 高 的 甲 基 化 水 平 是 大 麻 能 够 忍 受 重 金 属 胁 迫 的 原 因 。Bender(1998) 认 为 基 因 组DNA 甲 基 化 可 以 防 止 DNA 被 核 酸 内 切 酶 切 割 、 多 拷 贝 转 座 和 基 因 复 制 畸 变 , 因 此 植 物[24]基 因 组 DNA 甲 基 化 水 平 的 提 高 可 能 对 重 金 属 胁 迫 具 有 一 定 的 抵 抗 能 力 。 据 此 可 以 认为 , 通 过 提 高 植 物 基 因 组 的 DNA 甲 基 化 水 平 可 能 抵 御 重 金 属 胁 迫 。Labra(2004) 等 的 研 究也 证 实 这 一 推 测 , 单 克 隆 抗 体 免 疫 标 记 分 析 发 现 重 铬 酸 钾 处 理 的 油 菜 (Brassica napus L.)[25]胞 嘧 啶 超 甲 基 化 , 利 用 MSAP 分 析 CCGG 序 列 表 现 出 了 甲 基 化 的 广 泛 改 变 , 说 明 铬 胁迫 可 促 使 油 菜 基 因 组 甲 基 化 从 头 合 成 。 然 而 , 并 不 是 所 有 的 植 物 基 因 组 在 重 金 属 胁 迫 下都 表 现 出 高 水 平 的 DNA 甲 基 化 。Ni 2+ 、Cd 2+ 和 Cr 6+ 离 子 诱 使 三 叶 草 和 大 麻 基 因 组 胞 嘧 啶甲 基 化 程 度 降 低 20%-40% [23] 。 同 样 是 铬 处 理 , 在 油 菜 中 基 因 组 甲 基 化 水 平 表 现 上 升 趋 势[25] [23], 但 在 三 叶 草 和 大 麻 中 却 下 降 了 , 表 明 对 重 离 子 胁 迫 的 抵 抗 不 同 物 种 中 可 能 存 在 不同 的 DNA 甲 基 化 机 制 。2.2 低 温 与 植 物 基 因 组 DNA 甲 基 化低 温 胁 迫 诱 导 多 种 植 物 DNA 去 甲 基 化 , 当 玉 米 (Zea mays L.) 幼 苗 经 过 低 温 处 理 时 ,[11]利 用 高 效 液 相 色 谱 法 (HPLC) 观 察 到 其 根 部 组 织 发 生 全 基 因 组 去 甲 基 化 , 并 且 生 产 条 件恢 复 后 , 其 甲 基 化 水 平 仍 然 处 于 降 低 的 状 态 。Steward(2002) 等 利 用 甲 基 化 作 图 研 究 表 明 :玉 米 基 因 组 上 甲 基 化 在 低 温 胁 迫 下 以 核 小 体 为 单 位 呈 现 周 期 性 变 化 , 即 核 心 区 DNA 超 甲[11]基 化 而 连 接 区 低 甲 基 化 。 一 般 认 为 ,DNA 甲 基 化 水 平 降 低 可 活 化 染 色 质 并 促 使 基 因 高[11, 26]表 达 , 基 因 组 去 甲 基 化 可 激 活 转 座 子 。 金 鱼 草 (Antirrhinum majus) 转 座 子 Tam3 却 不像 那 些 “ 剪 切 - 插 入 ” 型 转 座 子 。Tam3 转 座 常 发 生 在 15 °C, 温 度 的 改 变 诱 导 基 因 组 中 Tam3[27]序 列 甲 基 化 水 平 的 特 异 变 化 , 即 高 温 超 甲 基 化 , 低 温 降 低 甲 基 化 。Hashida 等 研 究 表 明 :低 温 下 , 转 座 酶 在 DNA 复 制 和 细 胞 分 裂 结 束 后 立 即 结 合 于 Tam3 转 座 子 上 , 导 致 了 DNA[27]甲 基 化 水 平 降 低 。 说 明 低 温 引 起 的 全 基 因 组 甲 基 化 下 降 将 影 响 到 转 录 组 的 表 达 。37
华 南 农 业 大 学 农 学 院 第 三 届 综 述 大 赛 获 奖 作 品 论 文 集一 等 奖 作 品2.3 盐 和 水 分 与 植 物 基 因 组 DNA 甲 基 化高 盐 分 处 理 植 物 会 造 成 其 细 胞 渗 透 压 的 降 低 , 使 得 细 胞 吸 水 困 难 , 因 此 盐 胁 迫 常 与[3]水 分 亏 缺 相 伴 发 生 。 高 盐 浓 度 处 理 下 的 冰 叶 日 中 花 (Mesembryanthemum crystallinum) 观[28]察 到 CNG 甲 基 化 水 平 提 高 。Wang(2011) 等 对 盐 敏 感 型 水 稻 (Oryza sativa L.) 品 种 IR29和 耐 盐 型 重 组 自 交 系 水 稻 品 种 FL478 的 种 子 进 行 NaCl 处 理 , 利 用 MSAP 分 析 不 同 生 育时 期 ( 苗 期 、 分 蘖 期 和 快 速 生 长 期 ) 根 和 叶 组 织 的 DNA 甲 基 化 水 平 , 发 现 FL478 比 IR29[29]的 DNA 甲 基 化 要 高 。 表 明 植 物 基 因 组 DNA 甲 基 化 水 平 的 提 高 可 能 与 抗 盐 胁 迫 能 力 有关 ,Tan(2010) 的 研 究 也 证 明 了 这 点 。 通 过 MSAP 检 测 PEG 和 NaCl 处 理 过 的 玉 米 幼 苗 ,这 两 种 处 理 均 可 造 成 DNA 甲 基 化 的 改 变 , 得 出 结 论 认 为 甲 基 化 的 改 变 即 可 以 响 应 胁 迫 反[30]应 , 同 时 可 能 参 与 胁 迫 环 境 的 适 应 反 应 。 在 基 因 组 甲 基 化 水 平 上 升 的 背 景 下 , 盐 胁 迫[3]也 可 能 造 成 特 异 位 点 的 低 甲 基 化 。MSAP 法 分 析 盐 胁 迫 下 水 稻 品 种 FL478 和 IR29 苗 期的 根 时 发 现 DNA 甲 基 化 有 下 降 的 趋 势 , 其 中 IR29 根 部 DNA 去 甲 基 化 的 程 度 比 FL478要 高 , 但 是 分 蘖 期 和 快 速 生 长 期 根 部 的 DNA 甲 基 化 并 没 有 明 显 的 改 变 。 其 中 , 快 速 生 长[29]期 时 FL478 的 叶 片 在 盐 胁 迫 后 DNA 甲 基 化 水 平 有 稍 微 地 增 加 。 表 达 分 析 玉 米 的 MSAP片 段 发 现 盐 诱 导 根 部 内 含 子 甲 基 化 的 zmPP2C 表 达 量 明 显 下 调 , 而 盐 诱 导 叶 片 的 去 甲 基[30]化 zmGST 的 表 达 量 只 轻 微 上 调 。 因 此 , 认 为 植 物 基 因 组 DNA 甲 基 化 具 有 组 织 、 生 长阶 段 特 异 性 , 植 物 基 因 组 DNA 甲 基 化 的 这 种 特 异 性 在 干 旱 胁 迫 下 也 有 相 似 的 表 现 。 黎 志康 等 研 究 DK151 和 IR64 水 稻 品 种 在 干 旱 诱 导 下 DNA 甲 基 化 水 平 在 三 个 生 长 发 育 时 期 和两 种 组 织 中 的 变 化 , 发 现 两 个 品 种 叶 片 的 DNA 甲 基 化 和 去 甲 基 化 水 平 在 分 蘖 期 都 要 高 于快 速 生 长 期 和 抽 穗 期 , 并 提 出 了 干 旱 胁 迫 下 诱 导 的 DNA 甲 基 化 变 化 在 不 同 的 生 长 发 育 时[31]期 和 组 织 具 有 显 著 的 特 异 性 。2.4 其 他 胁 迫 与 植 物 基 因 组 DNA 甲 基 化利 用 诱 变 技 术 人 工 诱 发 遗 传 变 异 是 丰 富 作 物 种 质 资 源 , 选 育 新 品 种 的 重 要 手 段 之 一[32]。 利 用 诱 变 手 段 进 行 育 种 , 可 以 有 效 改 良 诸 如 早 熟 性 、 株 高 、 抗 病 性 、 籽 粒 品 质 性 状[32]等 遗 传 比 较 简 单 的 性 状 。 诱 变 可 诱 使 植 物 基 因 组 或 染 色 体 等 的 变 异 , 因 此 为 植 物 的 遗传 学 和 细 胞 学 等 研 究 提 供 了 新 的 资 源 。 目 前 , 越 来 越 多 的 人 开 始 关 注 于 植 物 诱 变 机 理 方面 的 研 究 , 其 中 也 有 探 讨 与 DNA 甲 基 化 的 关 系 方 面 的 研 究 。Ou(2010) 等 研 究 空 间 诱 变 对水 稻 DNA 甲 基 化 的 改 变 和 基 因 表 达 时 发 现 : 空 间 诱 变 诱 使 水 稻 基 因 组 DNA 超 甲 基 化 ;其 中 转 录 因 子 甲 基 化 的 改 变 发 生 在 CG 和 CNG 位 点 , 细 胞 基 因 只 CNG 位 点 发 生 甲 基 化改 变 , 并 且 这 种 改 变 可 以 遗 传 给 后 代 ; 这 两 类 基 因 的 表 达 同 样 可 以 遗 传 给 后 代 ; 作 者 还发 现 一 些 编 码 DNA 甲 基 转 移 酶 的 基 因 、DNA 转 葡 糖 基 酶 、DDM1 和 siRNA 相 关 蛋 白 对[33]空 间 诱 变 特 别 敏 感 。 有 研 究 者 利 用 2Gy 重 离 子 模 拟 空 间 环 境 辐 照 水 稻 种 子 ,MSAP 方法 分 析 种 子 辐 照 后 有 8.13% 多 态 性 , 而 幼 苗 辐 照 后 只 有 1.3% 的 多 态 , 显 示 高 能 量 低 剂 量的 重 离 子 对 水 稻 种 子 和 幼 苗 的 基 因 组 甲 基 化 状 态 都 产 生 了 影 响 , 且 种 子 受 到 辐 照 后 产 生[34]的 甲 基 化 改 变 明 显 高 于 幼 苗 。 进 一 步 证 实 了 空 间 诱 变 的 确 可 作 为 产 生 表 观 遗 传 现 象 的38
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