Identifikation und immunologische Charakterisierung von MHC ...

5. Diskussion
T-Helferzellepitopen in solchen TA, die bereits bekannte Zielantigene von
CD8+ CTL-Reaktionen waren.
Ein Verfahren zur Aufdeckung von MHC-II-abhängigen Peptidepitopen in
definierten Proteinantigenen basiert auf überlappenden synthetischen
Peptiden, die die gesamte Primärsequenz des Antigens abdecken (Tsukui et al.,
1998). Die in vitro Stimulation von T-Zellen mit diesen Peptiden ist wegen der
Größe der ausgewählten Proteine aber nicht praktikabel. Für das kleinere
Survivin (SVN) hätten 32 überlappende Peptide (15mere; Peptidabstand 4 AS)
in die Induktion von T-Zellreaktionen eingesetzt werden müssen, für die
Proteinase 3 (PR3) sogar 60 überlappende Peptide. Von einer primären
Stimulation von TH-Zellen mit dieser Strategie wurde daher abgesehen.
Ein alternatives Verfahren basiert auf bioinformatischen Computerprogram-
men. Die Vollendung des humanen Genomprojektes und die Verfügbarkeit
von Algorithmen zur Vorhersage des HLA-Bindungsverhaltens von beliebigen
Peptiden erlauben die Identifizierung von neuen T-Zellepitopkandidaten.
Proteinantigene können somit auf potentielle MHC-I- und MHC-II-abhängige
Kandidatenepitope untersucht werden (Rammensee et al., 1995; Rammensee et
al., 1999; Lu and Celis, 2000; Bian et al., 2003). Mit dem Computerprogramm
TEPITOPE wurde 1999 die Möglichkeit geschaffen, Peptidliganden für
verschiedene HLA-Allele der Klasse II vorherzusagen (Sturnioli et al., 1999).
Dieses Programm beruht auf virtuellen Matrizen und berücksichtigt den
hohen Polymorphiegrad des HLA-Klasse-II-Systems. Hierdurch können
Kandidatenepitope prädiziert werden, die mit hoher Wahrscheinlichkeit an
mehrere HLA-DR-Allele binden (Bian and Hammer, 2004). Im Rahmen dieser
Arbeit wurden die tumorassoziierten Antigene (TAA) SVN und PR3, von
denen MHC-Klasse-I-Epitope bekannt sind, untersucht. Die Prädiktions-
bedingungen wurden so gewählt, dass die vorhergesagten Peptidepitope mit
hoher Wahrscheinlichkeit an mindestens zwei HLA-DR-Allele banden. Die
Epitopdeduktion ergab für SVN 6 und für PR3 11 Kandidatenepitope.
84