Identifikation und immunologische Charakterisierung von MHC ...

4. Ergebnisse
hoher Bindungswahrscheinlichkeit für unterschiedliche HLA-DR-Allele. Diese
insgesamt 17 Peptide wurden nach Synthese und chromatographischer
Aufreinigung in T-zellimmunologischen Versuchen eingesetzt. Die variable
Länge der Peptide resultierte aus überlappenden Epitopen, die gemeinsam in
einem Peptid berücksichtigt wurden (Tab. 4.3).
Peptid Position Aminosäuresequenz T-Zellfrequenz
SVN
S10 10-24 WQPFLKDHRISTFKN 8,64*10 -7
S22 22-36 FKNWPFLEGAAATPE 7,2*10 -7
S40 40-54 EAGFIHAPTENEPDL 8,64*10 -7
S58 58-72 FFCFKELEGWEPDDD 4,32*10 -7
S88 88-103 LGEFLKLDRERAKNKI 1,73*10 -6
S110 110-124 KNKIAKETNNKKKEF 8,64*10 -7
PR3
P41 41-58 YMASLQMRGNPGSHFCGG 5,76*10 -7
P58 58-76 GTLIHPSFVLTAAHCLRDI 7,2*10 -7
P67 67-84 PQRLVNVVLGAHNVRTQE 1*10 -6
P87 87-101 AHNVRTQEPTQQHFS 4,32*10 -7
P117 117-133 NDVLLIQLSSPANLSAS 8,64*10 -7
P166* 166-180 PAQVLQELNVTVVTF - - - - -
P166 166-188 PAQVLQELNVTVVTFFCRPHNIC 7,2*10 -7
P187 187-201 ICTFVPRRKAGICFG 7,2*10 -7
P216 216-233 IDSFVIWGCATRLFPDFF 4,32*10 -6
P235 235-262 RVALYVDWIRSTLRRDWIRSTLRRVEAK 5,76*10 -7
P239 239-256 YVDWIRSTLRRVEAKGRP 1,58*10 -6
Tabelle 4.3: Bezeichnungen, AS-Positionen und AS-Sequenzen der synthetischen SVN- bzw.
PR3-Peptide. Die Abschätzung der Frequenzen peptidspezifischer T-Lymphozyten in peripherem
Blut von gesunden Kontrollprobanden erfolgte nach einwöchiger in vitro-Kultivierung von
T-Zellen und nachfolgender Restimulation mit synthetischen Peptiden in 48 separaten
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