ANÁLISIS ESTRUCTURAL DE LA PROTEÍNA EXTRÍNSECA PsbQ ...

Resultados
métodos. Con estos datos, se calculó un porcentaje medio que resultó en: 63.9 ± 8.8 % de α-
hélice, 7.0 ± 3.7 % de hoja-β y 29.4 ± 6.8 % de giros y estructuras no regulares. En la Figura 31
se muestra el ajuste a los datos experimentales por el método de LINCOMB (Perczel et al, 1992)
(Yang et al, 1986). Estos resultados indican que PsbQ es una proteína con una estructura
secundaria formada principalmente por una conformación α-hélice, con una pequeña proporción
de hoja-β y una cantidad considerable de estructura no regular.
Tabla VII. Estimación del porcentaje de estructura secundaria de PsbQ, a partir de su espectro
obtenido por CD, usando diferentes métodos computacionales. Considerando la aportación de cada
programa, se ha calculado la media para cada elemento de estructura secundaria .
Programa α-hélice (%) hoja-β (%) giros (%)
estructuras
no regulares (%)
LINCOMB 51.75 13.24 11.19 23.8
SELCON3 64.3 4.8 15.6 15.3
CONTIN/LL 62.3 4.8 113 21.1
CDSSTR 76.6 4.8 7.6 10.4
CDNN 64.5 7.55 12.25 17.18
media 63.9 ± 8.8 % 7.0 ± 3.7 % 29.4 ± 6.8 %
3.3. Análisis estructural por FTIR.
Dado que la señal del modo de vibración por torsión HOH de las moléculas de agua en la
espectroscopía de infrarrojos se solapa con la banda amida I de las proteínas, estas bandas se
estudiaron tanto en H 2O como en D 2O para obtener la máxima información. Sobre los espectros
de FTIR se calculó la segunda derivada del espectro y se realizó una deconvolución para asignar
los picos de las bandas vibracionales unitarias que componen las respectivas bandas amida I y I'.
En la interpretación sólo se asignaron las absorciones observadas en ambos espectros. Las
asignaciones se hicieron según correlaciones estructura-frecuencia establecidas (Jackson &
Mantsch, 1995).
El análisis por FTIR en la región 1700-1600 cm -1 de la proteína PsbQ recombinante de
espinaca muestra las bandas de amida I y I' con máximos alrededor de 1655 cm -1 y de 1645 cm -1 ,
respectivamente, a 21 ºC (Figura 32A). Estas bandas están compuestas por el solapamiento de
las señales de los componentes de estructura secundaria que representan segmentos de α-
hélice, hojas-β, giros, lazos, y estructuras no regulares. Por deconvolución de la banda y análisis
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