ANÁLISIS ESTRUCTURAL DE LA PROTEÍNA EXTRÍNSECA PsbQ ...

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Resultados
cianobacterias, oxi-fotobacterias verdes o algas no verdes (Kashino et al, 2002). Además, se ha
dectado homología entre la familia de proteínas de PsbP y otra familia de proteínas llamada
TL26 ("Thylakoid lumenal protein 26 kDa) con función aún desconocida aunque, por el análisis de
su péptido de tránsito, se prevé su localización en el lumen al contener su secuencia un motivo
relacionado con el mecanismo de transporte Tat , similar al utilizado por PsbP para la entrada a
este compartimento. Búsquedas de homólogos estructurales en la base de datos de DALI sólo
relaciona a PsbP con la proteína de código PDB 1EQ6, una proteína en levadura reguladora del
transporte nuclear de la proteína GTPasa Ran, aunque no parece que haya ninguna relación
funcional entre ambas (Ifuku et al, 2004).
Una búsqueda de secuencias homólogas de PsbQ en estos genomas proporciona un
conjunto de proteínas en los organismos procariotas de baja identidad de secuencia con
respecto a las proteínas PsbQ de plantas. Las proteínas con homología más cercana a plantas
superiores son las que pertenecen a Synechocystis y Synechococcus. Una búsqueda más
exhaustiva revela homología con genes en Anabaena y Thermosynechococcus, indicando que hay
familias de genes cercanos a PsbQ (PsbQ-like) en cianobacterias (Apéndice I, Ea). De hecho, el
producto del gen Synechocystis (sll1638) se ha detectado en preparaciones bioquímicas del
PSII aislado (Kashino et al, 2002) lo que indicaría que esta proteína podría estar unida al OEC en
determinadas circunstancias. No se encontró ninguna proteína homóloga a PsbQ en los genomas
de Gloeobacter ni en las oxi-fotobacterias verdes. En el caso de algas no verdes se ha
secuenciado recientemente la proteína de 20 kDa en Cyanidium que muestra una clara homología
con PsbQ de plantas, y a cuyo gen se le ha denominado psbQ' (Ohta et al, 2003). Además, PsbQ
presenta similitud (43 % de residuos conservados o con propiedades físico-químicas similares)
con la región N-terminal de la familia de proteínas TLP40 ("thylakoid lumenal protein 40 kDa")
(Apéndice I, Eb). Ésta es una familia de proteínas presente en todos los organismos oxi-
fotosintéticos de la que se ha deducido una doble función: (a) actividad peptidil-prolil isomerasa,
en su extremo C-terminal, con actividad auto-catalítica; (b) activiad proteolítica asocida con la
proteína D1 (Fulgosi et al, 1998).
En relación con la proteína PsbR, ésta sólo se ha localizado en el OEC de plantas
superiores y algas verdes (Apéndice I, F).