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ANÁLISIS ESTRUCTURAL DE LA PROTEÍNA EXTRÍNSECA PsbQ ...

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6.4. Calorimetría diferencial de barrido (DSC). 67<br />

6.5. Análisis de datos. 69<br />

6.5.1. Desnaturalización por agentes químicos. 69<br />

6.5.2. Desnaturalización por agentes térmicos. 70<br />

6.5.3. Medidas calorimétricas. 71<br />

RESULTADOS 73<br />

1. Análisis evolutivo de las proteínas extrínsecas del OEC 75<br />

2. Preparación y caracterización de la muestra de <strong>PsbQ</strong> 80<br />

2.1. Aislamiento de la proteína <strong>PsbQ</strong> nativa de espinaca y purificación. 80<br />

2.2. Expresión de la proteína <strong>PsbQ</strong> de espinaca recombinante y purificación. 82<br />

2.2.1. Construcción del vector de expresión. 82<br />

2.2.2. Expresión y purificación de <strong>PsbQ</strong> recombinante. 82<br />

2.3. Estudios por ultracentrifugación analítica. 83<br />

3. Estudio de la estructura secundaria de <strong>PsbQ</strong> por técnicas bioinformáticas<br />

y por técnicas biofísicas 86<br />

3.1. Análisis de la estructura 1D de <strong>PsbQ</strong> por técnicas bioinformáticas. 86<br />

3.1.1. Búsqueda en las bases de datos de proteínas homólogas<br />

de secuencia. 86<br />

3.1.2. Predicción de estructura secundaria de <strong>PsbQ</strong> por redes<br />

neuronales. 90<br />

3.2. Análisis estructural por CD. 93<br />

3.3. Análisis estructural por FTIR. 94<br />

4. Estudio de la estructura terciaria de <strong>PsbQ</strong> por técnicas bioinformáticas<br />

y por técnicas biofísicas 97<br />

4.1. Predicción del plegamiento por métodos bioinformáticos. 97<br />

4.1.1. Reconocimiento del plegamiento por threading. 97<br />

4.1.2. Selección del molde adecuado para la estructura de <strong>PsbQ</strong>. 102<br />

4.1.3. Construcción y evaluación del modelo de <strong>PsbQ</strong>. 103<br />

4.2. Análisis por absorción. 105<br />

Índice<br />

iii

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