THESE Anne POSTEC Diversité de populations microbiennes ...

Introduction bibliographique
Table des illustrations
Tableau 1 : Composition des minéraux les plus souvent impliqués dans la formation des édifices
hydrothermaux (Chevaldonné 1996). ……………………………………………………….……………….20
Tableau 2 : Compositions et caractéristiques physico-chimiques comparées du fluide de Rainbow et
de l’eau de mer. ……………………………………………………….……………………………………….23
Tableau 3 : Métabolismes microbiens associés aux sources hydrothermales océaniques (adapté de
Karl 1995). ………………………………………….…………….…………………………………………….36
Tableau 4 : Bacteria associées aux sources hydrothermales océaniques. …………………………40-44
Tableau 5 : Archaea associées aux sources hydrothermales océaniques. …………………………45-47
Tableau 6 : Températures maximales de croissance des principaux groupes d’organismes (Hobel
2004). ……………………………………………………….…………………………………………………...52
Tableau 7 : Caractéristiques des Bacteria et des Archaea………………………………………………..54
Tableau 8 : Pourcentage de microorganismes cultivables au sein de différents types d’habitats,
d’après Amann et al. (1995)……………………………………….…………………………………………..65
Figure 1 : Représentation schématique des sources hydrothermales océaniques (Baross & Deming
1993, Erauso 1994, Jannash & Mottl 1985)………………………………………………………….……...18
Figure 2 : Fumeur noir. ……………………………………………………….………………………………19
Figure 3 : Fumeur blanc. ……………………………………………………….…………………………….19
Figure 4 : Localisation des sites hydrothermaux marins profonds présentant une faune associée
(Querellou et al. 2001). ……………….……………………………………….………………………………21
Figure 5 : Riftia pachyptila. ……………………………………………………….…………………………..25
Figure 6 : Alvinella pompejana, ou "ver de Pompéi".………………………………………………………26
Figure 7 : Rimicaris exoculata. ……………………………………………………….……………………...26
Figure 8 : Bathymodiolus azoricus. ……………………………………………………….…………………27
Figure 9 : Effet de la température sur les taux de croissance de microorganismes types :
psychrophile, mésophile, thermophile et deux hyperthermophiles différents. Leurs optima de
température respectifs sont indiqués sur le graphique (Madigan et al. 2003). ….………………………52
Figure 10 : Arbre phylogénétique universel issu d’une analyse comparative de séquences de gènes
ribosomiques. Ces données soutiennent la discrimination entre les trois domaines, deux d’entre eux
contenant des représentants procaryotes (Bacteria et Archaea). L’enracinement représente la position
supposée du dernier ancêtre commun universel. Les groupes phylogénétiques contenant des
membres thermophiles ou exclusivement thermophiles sont indiqués en lignes pointillées (d’après
Madigan et al. (2003), cité par Hobel (2004)). ……………….……………………………………….…….53
Figure 11 : Structure membranaire des Archaea. (a) bicouche lipidique contenant des diéthers de
glycérol, (b) monocouche lipidique contenant des tétraéther de glycérol (Madigan et al. 2003)….…...55
Figure 12 : Colonne de Winogradsky (http://www2.ac-lyon.fr/enseigne/biotech/Winogradsky.html)…67
Figure 13 : Chambre de culture (160 x 20 x 20 mm) utilisée pour l’étude de Thermocrinis ruber. Les
constituants (plaques) en verre sont reliés par des joints en silicone (Huber et al. 1998)………….…..68
Figure 14 : (a) Schéma du système de culture en continu utilisé pour la croissance de
microorganismes hydrothermaux producteurs de filaments de soufre (SW: eau de mer oxygénée). (b)
microphotographies de filaments de soufre produits dans la culture, barre = 10 µm, et (c) de
microorganismes issus de la culture en bioréacteur (Taylor et al. 1999). ……….………………………68
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