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Discussion générale ε Proteobacteria Nautiliales Groupe F Groupe B Sulforuspirillum Figure 3 : Positionnement phylogénétique des séquences d’ε-Proteobacteria obtenues dans les différentes études: à partir de l’échantillon de cheminée, en culture d’enrichissement (fermenteur) à 90°C. Les séquences d’Alteromonas macleodii et d’Agrobacterium tumefaciens ont été utilisées comme outgroup. La méthode du Neighbour-joining, avec correction de Jukes et Cantor, a été appliquée. Les valeurs de bootstrap supérieures à 70 sont indiquées sur l’arbre. 214
Discussion générale Figure 4 : Positionnement phylogénétique des séquences de γ- et δ-Proteobacteria obtenues dans les différentes études: à partir de l’échantillon de cheminée, en culture d’enrichissement (fermenteur) à 90°C. Les séquences de Bacillus subtilis et Caminicella sporogenes ont été utilisées comme outgroup. La méthode du Neighbour-joining, avec correction de Jukes et Cantor, a été appliquée. Les valeurs de bootstrap supérieures à 70 sont indiquées sur l’arbre. 215
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