THESE Anne POSTEC Diversité de populations microbiennes ...

Résultats - Chapitre 3
Afin de poursuivre l’exploration des communautés microbiennes cultivables issues du
pôle chaud des sources hydrothermales océaniques, de nouvelles cultures d’enrichissement
ont été réalisées à 60°C. Après les conditions d’hyperthermophilie testées dans la
précédente étude, cette température devrait favoriser la croissance de thermophiles
modérés. Hormis le facteur température, les cultures d’enrichissement ont été réalisées dans
des conditions similaires à celles décrites précédemment : en continu en bioréacteur gas-lift,
et en batch en flacon, sur le milieu complexe F1 en présence de soufre, et en anaérobiose.
Différentes techniques moléculaires basées sur l’analyse du gène de l’ARNr 16S ont été
mise en oeuvre pour décrire la diversité microbienne des populations archéennes et
bactériennes cultivées à 60°C : DGGE, clonage et FISH. Des échantillons de la culture en
bioréacteur ont été prélevés quotidiennement et stockés, outre la congélation, à 4°C en
anaérobiose. Ces échantillons nous ont permis de sous-cultiver et isoler plusieurs ‘nouveaux’
microorganismes enrichis dans le bioréacteur, notamment une nouvelle espèce du genre
Thermosipho (une autre souche de cette nouvelle espèce est actuellement en cours de
description au laboratoire), une nouvelle espèce du genre Thermodesulfatator (en cours de
description au laboratoire), ainsi qu’une nouvelle espèce du genre Marinitoga,
M. hydrogenitolerans sp. nov., dont la caractérisation est décrite dans le chapitre 4.
169