THESE Anne POSTEC DiversitÃƒÂ© de populations microbiennes ...

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Résultats complémentaires - Chapitre 2 1 Tableaux et figures complémentaires Tableau 1 : Distribution et affiliation phylogénétique des séquences clonées d’ADNr 16S archéennes. T7 et T28 correspondent aux échantillons de culture prélevés au 7 è et 28 è jour de culture respectivement. Echantillon T7 T28 Affiliation phylogénétique Pyrococcus Pyrococcus Thermococcus Séquence type a Nombre de clones (et %) Représentant le(s) plus proche(s) Identité (%) b T7a-60 53 (90%) Pyrococcus sp. MV1019 AJ419868 99 T7a-44 6 (10%) Pyrococcus sp. MV1019 AJ419868 99 T28a-17 1 (2%) Pyrococcus abyssi AJ248283 Pyrococcus horikoshii AP000001 Pyrococcus furiosus AE010139 T28a-24 1 (2%) Pyrococcus sp. MV1019 AJ419868 97 T28a-18 45 (92%) ‘Thermococcus sulfurophilus’ AF394925 99 T28a-82 1 (2%) ‘Thermococcus sulfurophilus’ AF394925 98 T28a-87 1 (2%) ‘Thermococcus sulfurophilus’ AF394925 97 99 99 99 a > 97% de similarité entre les séquences d’un même phylotype. b résultats de BLAST. 153
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