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THESE Anne POSTEC Diversité de populations microbiennes ...

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<strong>Anne</strong>xe 3<br />

Caractérisation d’une nouvelle espèce microbienne : exemple <strong>de</strong> calculs<br />

pour la détermination <strong>de</strong> la température optimale <strong>de</strong> croissance.<br />

La gamme <strong>de</strong> température permettant une croissance est comprise entre 30 et 70°C.<br />

Des cultures ont été réalisées aux températures intermédiaires, et les cinétiques <strong>de</strong><br />

croissance correspondantes ont été établies.<br />

Prenons l’exemple <strong>de</strong> la température fixée à 60°C. Pour cette température, trois tubes<br />

ont été ensemencés et suivis par mesure <strong>de</strong> l’absorbance à 600 nm toutes les 30 min. Une<br />

première cinétique (absorbance 600 nm) = f (temps) est tracée pour chaque culture et<br />

correspond à la fonction suivante : C(t)= Co x e µt avec Co : concentration initiale<br />

µ : taux <strong>de</strong> croissance.<br />

60°C<br />

0,45<br />

0,4<br />

absorbance 600 nm<br />

0,35<br />

0,3<br />

0,25<br />

0,2<br />

0,15<br />

0,1<br />

DO 1<br />

DO 2<br />

DO3<br />

0,05<br />

0<br />

0 5 10 15 20 25 30<br />

temps (heures)<br />

La courbe Ln(absorbance 600 nm) = f (temps) est ensuite tracée, ce qui correspond à<br />

l’équation : Ln(C(t))= Ln (Co) + µt.<br />

Le taux <strong>de</strong> croissance µ max correspond à la pente maximale <strong>de</strong> la courbe obtenue, dans<br />

sa partie linéaire, i.e. pendant la phase exponentielle. En ne considérant que les points<br />

alignés (les phases <strong>de</strong> latence et stationnaire sont donc exclues), une courbe <strong>de</strong> tendance<br />

est insérée (logiciel Excel) : elle donne la pente et le coefficient <strong>de</strong> détermination R 2 .<br />

Voici l’exemple d’une <strong>de</strong>s trois cultures :<br />

60°C (1) y = 0,3573x - 4,6237<br />

R 2 = 0,996<br />

0<br />

-1<br />

0 2 4 6 8 10<br />

Ln (DO 1)<br />

-2<br />

-3<br />

-4<br />

-5<br />

Temps (h)<br />

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