Guia Clínica de l'HIV 2003 - Sida Studi

Pumarola-3.QXD 4/03/03 06:32 Página 80trol) i no conté en el seu genotip cap de les mutacions primàries causantsde resistència als antiretrovirals. Amb freqüència, aquests virus el fenotipi genotip dels quals és discordant contenen en el seu genoma polimorfismesen la seqüència de la transcriptasa inversa i de la proteasa. L’efecteque aquests polimorfismes pugui tenir sobre el fenotip de l’HIV-1 no estàben establert.L’existència en els laboratoris Virco d’una àmplia base de dades queté informació fenotípica i genotípica sobre més de 50.000 mostres hadonat lloc al concepte de fenotip “virtual” (VircoGEN II). Una vegada s’haobtingut el genotip viral, s’interroga la base de dades per tal d’identificarla sensibilitat als diferents antiretrovirals que corresponen en aquest genotip.El gran avantatge del fenotip virtual és que proporciona informacióràpida sobre la sensibilitat de l’HIV-1 una vegada conegut el seu genotip,sense que sigui absolutament necessari fer un test fenotípic. Tanmateix,el fenotip virtual té dos desavantatges importants: el primer és que labase de dades no inclou tots els possibles genotips, especialment elsseleccionats per noves combinacions de fàrmacs o nous antiretrovirals; elsegon és que l’accés en aquesta base de dades és limitat.Control de qualitatEn el moment actual, els mètodes virològics, i molt especialment, l’anàliside resistències de l’HIV-1, es duen a terme en laboratoris d’investigació,en laboratoris assistencials i en laboratoris comercials, sense ques’hagi establert de forma sistemàtica un procés d’estandardització delsdiferents mètodes ni un programa de control de qualitat universal. Coms’ha assenyalat anteriorment, els mètodes genotípics requereixen en primerlloc la utilització de la PCR per amplificar seqüències de l’HIV-1 apartir de mostres clíniques. Per tant, és fonamental que en els laboratorison es realitzen aquest tipus d’estudis es segueixin procediments estrictesper evitar problemes de contaminació quan s’utilitzen tècniques de PCR.També pot haver-hi contaminació durant la preparació dels productesamplificats per a la seqüenciació i en altres manipulacions tècniques. En80