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Die Fehlpaarung wurde dadurch erreicht, dass ein Cytosin-Rest im Target durch
einen Guanin-Rest ersetzt wurde. Als Referenz diente hierbei wiederum eine Küvette
mit reinem Puffer. Dabei wurde eine Schmelzpunkterniedrigung von 7 °C ermittelt
(Abb. 5.3). Eine Verstärkung der Schmelzpunkterniedrigung kann durch die
Kombination mit künstlichen Nukleinsäuren, z. B. PNA oder LNA erreicht werden.
Nach neuesten Erkenntnissen spielt dabei nicht nur die Ladung der Nukleinsäure,
sondern auch die Lage der Basenpaare in der Helix eine Rolle 123 .
5.2 Vergleich der verwendeten Sonden und SAM’s
5.2.1 Signalstabilität der Sonden
In der hier vorliegenden Arbeit wurden Sonden mit 3 verschiedene Linkern verwendet.
Dabei handelt es sich um einen Monothiol-Linker, einen zweifach Dithiollinker
und einen dreifachen Dithiollinker. Diese Linker wurden bereits in Abb. 3.5
dargestellt. Ursprünglich wurden die Messungen in 0,5 M Natriumsulfat mit einer
tetrathiolmodifizierten Sonde durchgeführt. Leider stand uns aufgrund von Lieferproblemen
nur eine Charge zur Verfügung, die allerdings über 12 Messungen ein
stabiles Signal mit einem Signalverlust von ca. 20 % lieferte.
Da diese Charge sehr schnell verbraucht wurde, musste auf die wesentlich leichter
erhältliche Monothiol-Sonde ausgewichen werden.
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