Living Image 3.1

Living Image ® Software User’s Manual
Contents
1 Welcome . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1
1.1 What’s New In the Living Image 3.1 Software . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1
1.2 About This Manual . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2
1.3 Contacting Caliper Technical Support . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3
2 Getting Started . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5
2.1 Overview of Imaging & Image Analysis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5
2.2 Starting the Living Image ® Software . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9
2.3 Living Image Help . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10
3 Initializing the System & Acquiring Images . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11
3.1 Initializing the IVIS Imaging System . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11
3.2 Checking the System Temperature . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12
3.3 About the IVIS Acquisition Control Panel & Auto Exposure Feature . . . . . . . . . . . . . . 13
3.4 Acquiring a Single Bioluminescence Image . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 14
3.5 Acquiring a Single Fluorescence Image With Epi-Illumination . . . . . . . . . . . . . . . . . 17
3.6 Acquiring a Fluorescence Image With Transillumination . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19
3.7 Setting Up an Image Sequence . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21
3.8 Acquiring an Image Sequence . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 30
3.9 Manually Setting the Focus . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 32
3.10 Manually Saving Image Data . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 33
3.11 Exporting Image Data . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 34
4 Working With Images . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35
4.1 Browsing & Opening Image Data . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35
4.2 The Tool Palette . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 40
4.3 Working With an Image Sequence . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 40
4.4 Creating an Image Sequence from Individual Images . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 43
4.5 Working With a Single Image . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 45
4.6 Viewing Image Information . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 49
4.7 Adjusting Image Appearance . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 52
4.8 Correcting or Filtering Image Data . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55
4.9 Image Information Tools . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 56
4.10 Rendering Intensity Data in Color . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 63
4.11 Viewing Transillumination Data . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 65
4.12 Image Layout Window . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 66
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