2. Material und Methoden - ArchiMeD
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Z78160|MMZ78160 M.musculus partial cochlear mRNA (clone 28D2)<br />
Length = 835<br />
Identities = 165/203 (81%), Positives = 165/203 (81%), Strand = Plus / Plus<br />
Query: 37 AGATACAAGCCTTAAAGATGGCCTTTTCCATGAATTTAAGAAATTTGGAAAAGTAACTTC<br />
||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || | || ||<br />
Sbjct: 94 AGACACAAGCCTTAAAGACGGCCTTTTCCATGAGTTTAAGAAGTTTGGCAAGGAGACGTC<br />
Query: 97 AGTGCAGATACATGGAACTTCAGAAGAGAGGTATGGTCTGGTATTCTTTCGGCAGCAAGA<br />
||||||||| || || | || || ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||<br />
Sbjct: 154 AGTGCAGATCCACGGGGCCTCCGAGGAGAGATACGGCCTGGTGTTCTTCCGGCAGCAAGA<br />
Query: 157 GGACCAAGAAAAAGCCTTGACTGCATCAAAAGGAAAACTTTTCTTTGGCATGCAGATTGA<br />
||||||||||||||| | ||| ||||| || || || || ||||| ||||||||||| ||<br />
Sbjct: 214 GGACCAAGAAAAAGCATAGACCGCATCCAAGGGGAAGCTCTTCTTCGGCATGCAGATCGA<br />
Query: 217 AGTAACAGCATGGATAGGTCCAG 239<br />
| || |||||| ||| ||||<br />
Sbjct: 274 GGAGACTGCATGGGAAGGACCAG 296<br />
ERGEBNISSE<br />
Abb. 23: DNA-Sequenzvergleich des 5´-Bereichs von EST-Klons Efc34 mit einer aus<br />
einer Maus isolierten cDNA-Klon.<br />
1 AGAGAGAATTAATAACTTGGTTTTTTTTGGGAATTTAGATACAAGCCTTAAAGATGGCCT 60<br />
P34.1F→<br />
61 TTTCCATGAATTTAAGAAATTTGGAAAAGTAACTTCAGTGCAGATACATGGAACTTCAGA 120<br />
121 AGAGAGGTATGGTCTGGTATTCTTTCGGCAGCAAGAGGACCAAGAAAAAGCCTTGACTGC 180<br />
←P34.1R<br />
181 ATCAAAAGGAAAACTTTTCTTTGGCATGCAGATTGAAGTAACAGCATGGATAGGTCCAGG 240<br />
P34.2F→<br />
241 TAAGACACAAGCAAGCTGAGTTTGAGTTACTCATCACACACACTGTTTGTGTTGCAGTGT 300<br />
301 ATGAGAGGGCAGCATATGATCCTGAATGAGGACACTATTCTGGCTTTATTTATTGACATA 360<br />
361 TTTCCATTGTCTTCTGTTTTAAAAGATGGTTCTATTTATTGTTCAACTTAATAAAAAACA 420<br />
←P34.2R<br />
421 TTGTTTTGGTTAGGGAGGATAGATTTTTCTGTTGCTGGGATTACAGGTGTTAGCTACCAT 480<br />
481 GCCTGGCCTTCATTTTTATAATACAAACTTGTGTAGAACTTTTTGTTGCCTTATTAATGA 540<br />
561 TTTCTTTTTTCTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCCCCAGGCTGGAGCGGAGTTTG 600<br />
601 CAGTGAGCTGAGGTCAGGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCTGTCTC 660<br />
661 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA<br />
Abb. 24: Sequenz des EST-Klons Efc34.<br />
Das mögliche Polyadenylierungssignal ist eingerahmt. Unterstrichene Primersequenzen wurden zur<br />
Isolierung überlappender cDNA-Klone verwendet.<br />
Homologievergleiche mit der Sequenz zeigten im weiter 3´-gelegenen Abschnitt eine<br />
Sequenzübereinstimmung von 100% zu dem humanen EST-Klon Z37007 (Abb. 25).<br />
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