2. Material und Methoden - ArchiMeD

DISKUSSION
Die Sequenzinformation des Klons Efc205 konnte mit Hilfe des UniGene-Programms von
559 Bp auf 2412 Bp verlängert werden. Ein weiterer Homologievergleich führte zu keinem
Ergebnis. Durch das UniGene Programm konnte die chromosomale Lokalisation des Gens auf
Chromosom 12 zwischen den Markern D12S322 und D12S327 ermittelt werden. Es handelt
sich dabei um eine 3 cM große Region in der u. a. auch die Matrixproteine Lumican an
Position 12q22 und Decorin an Position 12q21.3-23 lokalisiert sind (Grover et al., 1995).
Lumican und Decorin sind Leucin-reiche Proteoglykane, die u. a. auch in der extrazellulären
Matrix von Gelenkknorpel exprimiert werden (Grover et al., 1995). Darüber hinaus konnte
durch Kopplungsanalyse die Brachydaktylie Typ C (BdC) in der Region 12q24 lokalisiert
werden (Polymeropoulos et al., 1996). BdC ist gekennzeichnet durch die Verkürzung
einzelner oder mehrerer Finger oder Zehen (betroffen sind mittlere und proximale Phalangen
des zweiten, dritten und fünften Fingers). Jedoch konnte die BdC kritische Region auf einen
Bereich von 9 cM um den Marker D12S367 eingegrenzt werden, ein Bereich, der mindestens
65 cM von Efc205 entfernt ist. Somit scheidet Efc205 als Kandidatengen für BdC
wahrscheinlich aus.
Auch der EST-Klon Efc190 konnte mit Hilfe des UniGene Programms von 109 Bp auf 1137
Bp verlängert werden. Die überlappenden EST-Klone des „UniGene Cluster“ wurden aus acht
cDNAs isoliert, die aus verschiedenen Geweben hergestellt wurden (”in-silico”
Expressionsnachweis). Homologievergleiche mit der verlängerten Sequenz zeigten auf
Nukleotid- und auf Proteinebene eine signifikante Homologie zu dem pro-apoptotischen
Protein p52 des Huhns. (Accession Nummer: AF029071; Sun et al., 1998). Apoptose spielt
auch bei der Knorpelentwicklung eine entscheidende Rolle, so konnten apoptotische Zellen in
der Wachstumsfuge nachgewiesen werden. Der genaue Reaktionsmechanismus ist noch wenig
verstanden, doch ist davon auszugehen, dass neben den bereits bekannten Faktoren (z. B. Bcl-
2, Ihh, PTHrP) weitere Moleküle an dem apoptotischen Reaktionsmechanismus beteiligt sind.
Möglicherweise handelt es sich bei Efc190 um einen solchen Faktor. Durch einen weiteren
Homologievergleich mit der NCBI-Datenbank konnte festgestellt werden, dass die
vollständige cDNA-Sequenz kloniert und sequenziert ist (Carim et al., 1999). Das ubiquitär in
adulten Geweben exprimierte PDCD9-Gen (programmed cell death 9) hat einen offenen
Leserahmen von 438 Aminosäuren. Darüber hinaus konnte die von mir vermutete
chromosomale Lokalisation auf 5q11 durch FISH-Analyse bestätigt werden (Carim et al.,
1999). Eine mögliche erbliche Erkrankung, die mit diesem Locus gekoppelt vorliegt, gibt es
zur Zeit nicht.
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