2. Material und Methoden - ArchiMeD

ERGEBNISSE
Tab. 12). Die vierte Kategorie beinhaltet 11 EST-Klone (4,5%) die auch mit der EST-
Datenbank keine Sequenzübereinstimmungen erkennen ließen. Diese EST-Klone sind in
Tabelle 13 aufgelistet.
Der fünften Kategorie wurden Klone zugeordnet, die nicht weiter bearbeitet wurden. Es
handelt sich dabei um fünf Klone die Homologie zu repetitiven Sequenzen zeigen, sowie
21 Klone mit verschiedensten Sequenzunregelmässigkeiten, wie z. B. fehlender Vektor-Linker
Anteile.
3.2.1.1 EST-Klone mit Homologie zu bekannten Genen
155 EST-Klone (62%), die Homologie zu bekannten Genen zeigen, lassen sich entsprechend
ihrer Funktion in neun Gruppen einteilen (Tab. 8.1-8.9). In Tab. 8.1 sind 12 ESTs (4,7%), die
Homologie zu Proteinen der extrazellulären Matrix zeigen, zusammengefasst. Die Tatsache,
dass fünf unabhängige EST-Klone aus der cDNA-Bank isoliert werden konnten, die Teilen
der Typ II Kollagen-cDNA entsprechen, zeigt, dass die cDNA-Bibliothek das spezifische
Expressionsmuster von Knorpel widerspiegelt. Der Nachweis weiterer knorpelspezifischer
Gene wie Osteonektin, Fibronektin und Cartilage oligomeric matrix protein (COMP) bestätigt
diese Annahme. Tabelle 8.2 fasst die zahlenmässig umfangreichste Gruppe verwandter
cDNAs zusammen. Es handelt sich um EST-Klone, die Homologie zu Genen zeigen, die an
der Translation beteiligt sind. Die weiteren Gruppen fassen ESTs zusammen die Homologie
zu Proteasen, Membranproteinen, Cytoskelettproteinen, mitochondrialen Proteinen besitzen
bzw. cDNAs die an verschiedenen Stoffwechselprozessen bzw. an der Transkription beteiligt
sind (Tab. 8.3-8.8). In Tabelle 8.9 sind ESTs zusammengefasst, die Homologie zu Proteinen
mit bekannter Funktion besitzen, die aber aufgrund geringen Auftreten nicht in einzelne
funktionelle Einheiten aufgeteilt wurden.
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