2. Material und Methoden - ArchiMeD

4.3.1 Homologievergleich der erhaltenen EST-Sequenzen
DISKUSSION
Die bei der Durchführung des EST-Projekts gefundenen EST-Sequenzen wurden aufgrund
ihrer Homologievergleiche in verschiedene Kategorien eingeteilt. Die Kategorie (1) enthält
ESTs mit signifikanten Homologien zu bekannten, auch funktionell charakterisierten Genen
(Tabelle 8.1-8.9). In den Kategorien (2-3) sind solche ESTs zusammengefasst, die ebenfalls
signifikante Homologien zu Sequenzen der nr- bzw. EST-Datenbank zeigen (Tabelle 9-12),
über deren funktionelle Bedeutung aber keine Aussage gemacht werden kann. Die vierte
Kategorie umfasst alle EST-Sequenzen, die nur schwache oder keine Homologien zeigen
(Tabelle 13). Es handelt sich bei diesen Sequenzen höchstwahrscheinlich um ESTs aus bisher
unbekannten neuen Genen. In der fünften Kategorien sind die EST zusammengefasst, die
aufgrund von Homologie zu repetitiven Sequenzen bzw. verschiedenen
Sequenzunregelmässigkeiten, wie z. B. fehlender Vektor-Linker Anteile, nicht weiter
bearbeitet und auch nicht diskutiert werden.
ESTs mit Homologie zu Genen mit bekannter Funktion:
Insgesamt konnten 155 (62%) EST-Klone in Kategorie (1) zusammengefasst werden.
Entsprechend ihrer Funktion wurden sie in 9 Untereinheiten eingeteilt. Die Untereinheiten
und das prozentuale Vorkommen der entsprechenden ESTs ist in Tabelle 15 dargestellt.
Tabelle 15
Einteilung der EST-Klone die Homologie zu bekannten, auch funktionell
charakterisierten Genen zeigten
Anzahl der nachgewiesenen ESTs
(%)
Funktion der nachgewiesenen ESTs
68 (44%) Translation
20 (13%) unterschiedliche Stoffwechselprozesse
13 (8,3%) sonstige Funktionen
12 (7,7%) extrazelluläre Matrixproteine
12 (7,7%) Proteasen
12 (7,7%) Membranproteine
8 (5,2%) Transkription
6 (3,9%) mitochondriale Proteine
4 (2,6%) Zytoskelettproteine
13 (8,3%) sonstige Funktion
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