2. Material und Methoden - ArchiMeD

Abb. 29: Schematische Darstellung aller möglichen Spleißvarianten.
ERGEBNISSE
Wie in Abb. 29 angedeutet konnte der Nachweis acht verschiedener Spleißvarianten erbracht
werden. Die Auswertung der Sequenzergebnisse zeigte, dass aufgrund des Fehlens bzw.
Vorhandenseins des 1208 Bp Exons zwei unterschiedliche Translationsstartpunkte existieren
und somit zwei unterschiedliche Proteine entstehen. Fehlt das 1208 Bp Fragment (smfc34+/+;
smfc34+/-, smfc34-/+, smfc34-/-) ist die Konsensussequenz identisch mit der kürzlich
veröffentlichten MINT-Sequenz (Newberry et al., 1999). Smfc34 (alle vier möglichen
Varianten) besitzt an Position +53 ein ATG-Start-Codon, dessen Umgebung
Übereinstimmung zu der nach Kozak (1996) beschriebenen Konsensussequenz für
Translationsstarts aufweist. Die Sequenzanalyse ergab einen putativen offenen Leserahmen
von 1498 Aminosäuren, wobei in der vorliegenden Arbeit nicht die vollständige
proteincodierende Sequenz von smfc34 isoliert wurde. Die Aminosäuresequenz des
veröffentlichten Gens ist im Vergleich zu smfc34 2078 Aminosäuren länger. In Abb. 30 ist
nur der Bereich abgebildet der deutliche Unterschiede zu der veröffentlichten Sequenz besitzt.
Eine Motivanalyse des proteincodierenden cDNA-Bereiches lieferte drei RNA-
Erkennungsstellen im N-terminalen Bereich.
Bei Vorliegen des 1208 Bp Exons (lmfc34+/+; lmfc34+/-, lmfc34-/+, lmfc34-/-) (Abb. 29)
wird der putative offene Leserahmen zerstört. Ein möglicher Transkriptionsstart ist an
Position +2271 lokalisiert, wobei dessen Umgebung aber nicht der Konsensussequenz für
Translationsstarts entspricht. Das Protein wäre um das erste RNA-Erkennungsmotiv verkürzt.
Die zwei 69 Bp und 99 Bp alternativen Exons verursachen keine Veränderung des offenen
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