2. Material und Methoden - ArchiMeD
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3.<strong>2.</strong>1.2 EST-Klone mit Homologie zu Sequenzen unbekannter Funktion<br />
ERGEBNISSE<br />
In den letzten Jahren kam es vor allem aufgr<strong>und</strong> des humanen Genomprojekts zur vermehrten<br />
Sequenzierung von PAC-, BAC- bzw. Cosmidsequenzen <strong>und</strong> zur Veröffentlichung dieser<br />
Sequenzen in Datenbank. Neben der reinen Sequenzinformation liegen zum Teil weitere<br />
Informationen bezüglich der chromosomalen Lokalisation aber auch möglicher transkribierter<br />
Bereiche vor. In Tabelle 9 sind 11 EST-Klone zusammengefasst, die Homologie zu solchen<br />
Sequenzen zeigen. Bei 7 EST-Klonen liegen Informationen bezüglich der chromosomalen<br />
Lokalisation vor. Die Homologie der EST-Klone Efc83, Efc193, Efc200 <strong>und</strong> Efc224 liegt in<br />
Bereichen, die als mögliche transkribierte Abschnitte beschrieben werden. Funktionelle<br />
Angaben über die möglichen Gene liegen nicht vor.<br />
Tabelle 9<br />
Zusammenfassung aller ESTs, die Homologie zu BACs, PACs bzw. Cosmiden besitzen<br />
Klon<br />
Größe<br />
(Bp) Herkunft Accession<br />
No.<br />
BlastN<br />
P-<br />
Wert<br />
%<br />
Überein<br />
-stimmung<br />
Efc 6 99 Homo sapiens cosmid clone U169D2 from Xp2<strong>2.</strong>1-<br />
2<strong>2.</strong>2<br />
U72788.1 1e -07 96<br />
Efc36 129 Homo sapiens chromosome 19, cosmid R26529 AC005551 5e -38 100<br />
Efc76 449 Homo sapiens clone NH0556H17 AC005237 0.0 99<br />
Efc83 230 Homo sapiens BAC clone NH0414C23 from Y AC006157 e -122 100<br />
Efc128 457 Homo sapiens clone NH0556H17 AC005237 0.0 98<br />
Efc134 463 Homo sapiens chromosome 4 clone C0481P14 map AC006160<br />
4p16<br />
0.0 100<br />
Efc179 411 Human DNA sequence from clone 554C12 on AL08024<strong>2.</strong>11<br />
chromosome 22<br />
e -121 99<br />
Efc193 541 Homo sapiens clone UWGC:y54c125 from 6p21 AC006165 0.0 98<br />
Efc196 510 Homo sapiens clone NH0449G16 AC007684 0.0 93<br />
Efc200 555 Homo sapiens chromosome Y, clone 475I1 AC004474 0.0 99<br />
Efc224 220 Homo sapiens PAC RPCI4-613B23 AC006059 0.0 99<br />
In Tabelle 10 sind 23 EST-Klone aufgelistet, die Homologie zu cDNA-Sequenzen<br />
unbekannter Funktion besitzen. Teilweise gibt es Informationen über chromosomale<br />
Lokalisation bzw. über das Expressionsmuster der cDNA-Sequenzen. Funktionelle Angaben<br />
über diese cDNAs liegen nicht vor. Bis auf eine Ausnahme zeichnen sich alle EST-Klone<br />
durch Homologie zu humanen cDNA-Sequenzen aus. Lediglich der Klon Efc34 zeigt<br />
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