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2. Material und Methoden - ArchiMeD

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INHALTSVERZEICHNIS<br />

3.<strong>2.</strong>3 Isolierung <strong>und</strong> Analyse des EST-Klons Efc34 90<br />

3.<strong>2.</strong>3.1 Analyse von Efc34 90<br />

3.<strong>2.</strong>3.2 Chromosomale Lokalisation des EST-Klons Efc34 93<br />

3.<strong>2.</strong>3.3 Isolierung eines homologen Maus-Gens mfc34 94<br />

3.<strong>2.</strong>3.4 Verifizierung <strong>und</strong> Analyse der ermittelten mfc34 Gensequenz 96<br />

3.<strong>2.</strong>3.5 Northern Analyse zur Bestimmung der Transkriptgröße von mfc34 99<br />

3.<strong>2.</strong>3.6 Chromosomale Lokalisation von mfc34 101<br />

3.3 Serial Analysis of Gene Expression (SAGE) 103<br />

3.3.1 Herstellung einer Chondrosarkom-SAGE-Bank 105<br />

3.3.2 Auswertung der Sequenzdaten 108<br />

4 Diskussion 112<br />

4.1 Das humane FGFR3-Gen 112<br />

4.1.1Merkmale der FGFR-Familie 112<br />

4.1.2 Die genomische Struktur des humanen FGFR3-Gens in Vergleich mit der murinen<br />

Fgfr3 Sequenz 113<br />

4.1.3 Klinisches Spektrum der FGFR3-Defekte <strong>und</strong> ihre molekulare Ursache 115<br />

4.1.4 Mutationsanalyse 118<br />

4.1.5 Expression alternativer Spleißvarianten des murinen Fibroblasten-Wachstumsfaktor-<br />

Rezeptor 3 (Fgfr3) 123<br />

4.2 <strong>Methoden</strong> zur Identifizierung differenziell exprimiertere Gene 124<br />

4.3 Analyse von EST-Klonen aus einer humanen Chondrozyten-cDNA-Bank 129<br />

4.3.1 Homologievergleich der erhaltenen EST-Sequenzen 130<br />

4.3.2 Gesamtbewertung der durchgeführten Sequenzierungen 134<br />

4.3.3 Detaillierte Analyse des Klons Efc34 135<br />

4.4 Serial Analysis of Gene Expression (SAGE) 137<br />

5 Zusammenfassung 140<br />

6 Literaturverzeichnis 142<br />

7 Anhang 155<br />

7.1 Danksagung 155<br />

7.2 Lebenslauf 156<br />

7.3 Veröffentlichungen 158<br />

III

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