2. Material und Methoden - ArchiMeD

ZUSAMMENFASSUNG
beurteilt. Die Sequenzanalyse von 251 Klonen, zeigte dass 62% der analysierten Fragmente
signifikante Homologie zu cDNA-Sequenzen besitzen, die bekannten und charakterisierten
Genen entsprechen. Weitere 23% der sequenzierten Klone zeigten Homologie zu cDNA-
Sequenzen unbekannter Funktion bzw. zu Sequenzen der EST-Datenbank während bei 5%
keine Homologie nachgewiesen werden konnte. Die ermittelten Ergebnisse zeigen also, dass
5% der untersuchten EST-Klone neue, möglicherweise knorpelspezifsche Gene darstellen.
Die Ergebnisse sind ein deutlicher Hinweis darauf, dass die verwendete cDNA-Bank zur
Isolierung neuer, möglicherweise knorpelspezifischer Gene geeignet ist. Diese Einschätzung
wurde dadurch unterstützt, dass im Rahmen der durchgeführten EST-Sequenzierung ein Klon
(Efc34) isoliert und charakterisiert wurde, der im Verlauf der Arbeit als Msx2-interagierender
Faktor (MINT) publiziert wurde und in der Knorpel-/Knochen-Entwicklung eine wichtige
Rolle spielt.
In einem zweiten Versuchsansatz wurde die von Velculescu et al. (1995) veröffentliche SAGE
(„serial analysis of gene expression“)-Methode - ausgehend von RNA einer humanen
Chondrosarkom-Zelllinie - etabliert. Die relativ aufwendige Technik konnte erfolgreich
durchgeführt werden. Die Auswertung ergab, dass auch die bei dieser Versuchsreihe
verwendete Strategie die Möglichkeit eröffnet, systematisch gewebsspezifische Gene zu
isolieren.
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