Das Amygdala-Konnektom der Ratte - RosDok - Universität Rostock

Für die folgenden Analysen werden Regionen ohne Kanten, also die isolierten Knoten aus der
Verbindungsmatrix entfernt. Alle Regionen weisen einen intrinsischen Input auf, wohingegen
4 Regionen ohne intrinsischen Output bleiben. 25 Knoten besitzen sowohl intrinsischen Input
als auch Output.
Aus dem Konnektom des gesamten Rattennervensystems wurde in neuroVIISAS eine
sogenannte Variante abgeleitet und in der Projektdatei deOlmosPitkaenen14_2_12-1.brain
gespeichert, bei der die Amygdala nur noch die Regionen der linken und rechten Hemisphäre
beinhaltet, die de Olmos (2004) verwendet hat und deren in der tract-tracing Literatur
erwähnten Unterregionen.
Betrachtet man in dieser Variante die extrinsischen Inputs des Amygdala-Teilbaumes, so
projizieren 909 Regionen aus ipsilateralen (ohne ipsilaterale Amygdala-Untergebiete) und
kontralateralen (mit kontralateralen Amygdala-Untergebieten) Hirnregionen in die linke de
Olmos-Variante der Amygdala hinein (diese Zahl ergibt sich aus dem Fenster Input-Nachbarn
des Teilbaumes hinzufügen und Anzahl der Knoten).
Dieser Input in den Mandelkern besteht aus insgesamt 4287 Kanten (nur Amygdala-Knoten in
der de Olmos-Variante sind dargestellt und in Extrinsic statistic ist Subtree input sum
berechnet worden).
Die Knoten der Gliederungsebene nach de Olmos (2004) selbst erhalten einen Input von 2303
Kanten (de Olmos-Variante mit Knotenauswahldatei de Olmos Ebenen.xml mit der in der
Extrinsic statistic der Wert Direct input sum berechnet wurde).
Beim extrinsischen Output des Amygdala-Teilbaumes finden sich 995 Regionen der
ipsilateralen (ohne ipsilaterale Amygdala-Untergebiete) und kontralateralen (inklusive
kontralateren Amygdala-Untergebieten) Seite, die von der linken Amygdala Afferenzen
erhalten (diese Zahl ergibt sich aus dem Fenster Output-Nachbarn des Teilbaumes hinzufügen
und dort der Anzahl der Knoten) und mit ihr durch 3815 Kanten verbunden sind (nur
Amygdala-Knoten in der de Olmos-Variante sind dargestellt und in Extrinsic statistic ist
Subtree output sum berechnet worden).
Die Regionen der Gliederungsebene nach de Olmos (2004) haben einen Output von 1736
Verbindungen. Der in der Literatur dokumentierte extrinsische Input in die Amygdala ist also
größer als der extrinsische Output.
3.3 Konnektivitätsanalyse
Das Amygdalagebiet mit den meisten intrinsischen Konnektivitäten ist der Basomedial
amygdaloid nucleus mit insgesamt 41 Verbindungen zwischen seinem und den Teilbäumen
der anderen ausgewählten Knoten (s.a. Kapitel 3.4). Er verfügt über 18 Afferenzen (Input)
und 23 Efferenzen. Gleich danach folgt der Central amygdaloid nucleus mit ebenfalls 18
Afferenzen und 22 Efferenzen. Die Region mit den dritthäufigsten Konnektivitäten ist die
Amygdalopiriform transition area mit 18 Inputs und 20 Outputs. Gebiete mit weniger als 10
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