Pyruvat-Produktion durch acetatauxotrophe - JUWEL ...
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96 ERGEBNISSE<br />
zeigte eine steigende Intensität im Verlauf der Fermentation, während die unphosphorylierte<br />
TufA-Form (Spot 20) abnahm .<br />
Zwei Stressproteine zeigten eine zunehmende Intensität im Verlauf der Fermentation,<br />
nämlich das Chaperon DnaK und das universelle Stressprotein UspA . Demgegenüber nahm<br />
die Intensität der Glutamat-Decarboxylase GadA, einem Protein gegen Säurestress, im<br />
Verlaufe der Fermentation um etwa die Hälfte ab .<br />
Tab . 20 : Proteine, deren Konzentration sich während einer acetatlimitierten Fed-Batch-Fermentation<br />
von E. coli YYC2021dhA änderte . Unterschiede in den Proteinintensitäten wurden mit Hilfe der<br />
ProteomWeaver-Software (Definiens Imaging GmbH, München) festgestellt . Die Identifizierung der<br />
Proteine erfolgte <strong>durch</strong> Peptidmassenfingerprint-Analyse . Die Nummerierung bezieht sich auf die<br />
Proteinspots in Abb . 28 . Es wurden drei Phasen einer acetatlimitierten Fermentation von YYC2021dhA<br />
verglichen . Von jeder Phase wurden drei unabhängige 2D-Gele angefertigt . Spalte n gibt an, in wieviel<br />
der neun Gele die Proteinspots gefunden wurden . Die relative mittlere Proteinintensität gibt den<br />
Mittelwert der Proteinintensität nach 8 h, 12 h und 35 h an . Die molekulare Masse M (in kDa) und der<br />
pl wurden aus der Colibri-Datenbank entnommen (http ://genolist.pasteur .fr/Colibri/) . Bei den<br />
Proteinen, bei denen keine Zuordnung <strong>durch</strong> Peptidmassenfingerprint-Analyse möglich war, wurden<br />
Masse und pl aus dem 2D-Gel abgeschätzt . n .n . = nicht nachweisbar<br />
Nr. B Gen Beschreibung n relative mittlere M pl<br />
Glykolyse und Pentose-Phosphat-Weg<br />
Proteinintensität<br />
8h 12h 35h<br />
3 b2925 fbaA Fructose-Bisphosphat-Aldolase 7 3,4 1,4 0,6 39,0 5,5<br />
5 b2029 gnd Gluconat-6-Phosphat-Dehydrogenase 9 4,5 6,1 7,3 51,3 4,9<br />
Citratzyklus<br />
11 b1136 icd Isocitrat-Dehydrogenase (phosphoryliert) 6 1,5 n .n . 2,0 45,6 5,0<br />
13 b1136 icd Isocitrat-Dehydrogenase (dephosphoryliert) 9 10,9 5,0 5,4 45,6 5,0<br />
6 b3236 mdh Malat-Dehydrogenase 9 3,3 1,9 1,6 32,2 5,5<br />
Stressproteine<br />
10 b0014 dnak Chaperon 9 5,2 5,4 7,7 68,9 4,6<br />
17 b1237 hns DNA-Bindeprotein 9 2,6 4,0 3,9 15,4 5,2<br />
16 b2579 yfiD Radikalprotein, induziert <strong>durch</strong> Säurestress 9 1,8 3,3 0,8 14,1 4,9<br />
8 b3495 uspA Universelles Stressprotein 9 3,1 4,1 5,0 15,9 4,9<br />
22 b3517 gadA Glutamat-Decarboxylase 8 5,5 2,6 2,1 52,5 5,0<br />
Aminosäure-Stoffwechsel