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Balance anual sobre el estado de los ecosistemas y el ambiente de la amazonia colombiana 2006
Amazonia-Orinoquía” ubicado en la serranía de Chiribiquete, Serranía de Taraira y los cerros aislados de los
departamentos de Vaupés y Amazonas y gran parte de los departamentos de Guainía y Vichada.
2.1.4 Diversidad microbiana en suelos de la región amazónica colombiana
Clara Patricia Peña Venegas; Gladys Inés Cardona Vanegas 10
Los microorganismos son el grupo más numeroso y diverso de organismos en el planeta, albergando
aproximadamente el 15% del total de especies de organismos vivos en la Tierra. Actualmente se reconocen
más de 2.200 géneros y especies de bacterias en el mundo (DSMZ 2005), pero tan sólo el 10% de estas
han sido cultivadas y sólo 5000 especies de bacterias han sido adecuadamente descritas (Lee et al., 1996).
Igualmente se han descrito unas 70.000 especies de hongos, pero se presume que deben existir por lo menos
veinte veces más especies de hongos por descubrir (Hawkswoeth, 1991), restando el 95% de las especies
sin describir (Borneman & Hartin 2000).
Según el United States Departament of Agriculture - USDA (1998), el suelo es el lugar biológicamente
más diverso de la tierra, por lo que igualmente se podría suponer que es allí donde un mayor número de
microorganismos habitan. Las principales amenazas en la pérdida de biodiversidad edáfica corresponden
a la fragmentación de bosques, pérdida de huéspedes por actividades humanas, uso de agentes químicos,
cambio en la temperatura y microclima del suelo, cambios en la precipitación, y la introducción o mal manejo
de cepas de microorganismos asociados con la agricultura.
Los microorganismos se adaptan a microhábitats y viven juntos en consorcios que interactúan con
el ecosistema. La diversidad microbiana es crítica para el funcionamiento de un ecosistema debido a la
diversidad de procesos que los microorganismos controlan como: descomposición, ciclaje de nutrientes,
agregación del suelo y patogenicidad. Se estima que 1 gramo de suelo puede albergar más de 10 billones
de bacterias, con 4000-7000 especies diferentes y una densidad de biomasa de alrededor de 300-30.000
kg/ha -1 (Dubey et al., 2006).
Tradicionalmente, el conocimiento sobre ecología de microorganismos en los ambientes naturales se
limitaba a las técnicas clásicas de cultivo. Desde el punto de vista ecológico, el estudio con cultivos puros no
es muy relevante debido a que es posible cultivar sólo una pequeña proporción (0.1-10%) de microorganismos
que pueden visualizarse por procedimientos de conteo directo (Head & Saunders, 1998 citados por Cardona,
2004). Esta situación constituye una desventaja considerable para la ecología microbiana, lo que ha
llevado al empleo de técnicas moleculares que permiten estudios in situ de la diversidad microbiana, de sus
interacciones y de la diversidad de microorganismos cultivables y no cultivables. Estas técnicas permiten
estudiar la estructura y actividad de las poblaciones microbianas que no pueden ser aclaradas por técnicas
microbiológicas tradicionales (Rosado, 1997 citado por Cardona, 2004).
Dentro de éstas, el estudio de moléculas celulares que se conservan de generación en generación como
los genes 16S rRNA para bacterias y los ITS/18S para hongos, pueden ser útiles para discriminar grupos
taxonómicamente distantes o comparar grupos eco-fisiológicamente seleccionados. Estos genes son
10 Grupo de Investigación: Recursos genéticos y biotecnología (Instituto SINCHI)
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