verzeichnisse - ArchiMeD - Johannes Gutenberg-Universität Mainz

Weitere Magazine

Empfehlungen

Info

100 6 Diskussion Exon 1b (1) (2) Exon 11 (1) (2) TGCTGTCGGGCCCGCCGGCGCTCGGAAGTCCAGGCGCTTCTGTCGTTGTTCTTGAAGCTGTGGTGACCGTGGGATCCGAATCTTTCGAGGT AGCTTC TGGAGACTGAGGAGA TGCTGTCGGGCCCGCCGGCGCTCGGAAGTCCAGGCGCTTCTGTCGTTGTTCTTGAAGCTGTGGTGACCGTGGGATCCGAATCTTT GAGGTGAGCTTCTTGGAGACTGAGGAGA GTTAGATTTTAAGCTGCTTTTTGTCTTCAGAAGCTTTTAAAAAGAAAAGCGAATTAGG CCACTTCGATGTCACCTGTATAAAGGAAAATTTTGTTTACTTCTTTTGTTGTATC GTTAGATTTTAAGCTGCTTTTTGTCTTCAGAAGCTTTTAAAAAGAAAAGCGAATTAGGTCCACTTCGATGTCACCTGTATAAAGGAAAATTTTGTTTACTTCTTTTGTTGTATC Abb. 26: Sequenzabweichungen im Exon 1b und Exon 11 des murinen La/SS-B Fehlende Basen in der Datenbanksequenz von TOPFER et al. (1993) (GenBank accession No. L00993) (1) oder dem sequenzierten murinen La/SS-B (2) sind durch ein Leerzeichen gekennzeichnet. 6.3 Die Exons und Introns Das murine Gen besaß vom ersten Exon bis zur 3’-UTR eine Länge von 9982 bp, das humane Gen 10567 bp (Abb. 5 und 8.1). Somit differierte die Gesamtgröße des Gens zwischen diesen beiden Spezies nicht sehr stark. Beim Vergleich der Exons wurde festgestellt, dass die Größen der Exons 3, 4, 5, 6, 7 und 9 beim humanen und murinen Gen übereinstimmten. Die Exons 2, 8, 10 und 11 differierten in ihrer Größe zwischen 10 und 30 Nukleotiden (Tabelle 2). Auch beim Vergleich der Nukleotidsequenzen der Exons 2-11 ließen sich größe Übereinstimmungen feststellen. Dies hatte sicherlich die hohe Homologie des murinen und humanen La/SS-B-Proteins von etwa 76,7% zufolge. Größere Sequenzabweichungen ließen sich ab dem Exon 8 erkennen. Dies war vermutlich der Grund für die Homolgie der C-Termini des murinen und humanen Proteins von nur noch 65% (TOPFER et al., 1993) (1.6). Die Größen der verschiedenen Exon 1 wichen stark voneinander ab. Das humane Exon 1 besaß eine Länge von 156 bp, das Exon 1’ eine Länge von 489 bp und das Exon 1’’ eine Länge von 493 bp (Tabelle 2). Schon zwischen dem humanen Exon 1 und dem Exon 1’ bzw. 1’’ ließen sich in Bezug auf ihre Größe keine Gemeinsamkeiten feststellen. Das murine Exon 1a besaß eine Größe von 86 bp, das Exon 1b eine Größe von 113 bp und das Exon 1c eine Größe von 225 bp (Tabelle 2). Auch die Nukleotidsequenzen der humanen und murinen Exon 1 unterschieden sich vollständig voneinander (Abb. 5 und 8.1). Somit ließ sich keine Aussage darüber machen, welches humane Exon 1 einem murinen Exon 1 entsprach. Beim Vergleich der Intron-Sequenzen und Intron-Größen ließen sich fast keine Gemeinsamkeiten feststellen (Abb. 5 und 8.1), was sicherlich an den verschiedenen Spezies lag. Als einzige Gemeinsamkeit fand sich im Intron zwischen dem humanen Exon 1 und Exon 2 in der Sequenz des Exon 1’ bzw. Exon 1’’ eine Poly(T) 23 -Region (8.1). Auch in der murinen Sequenz fand sich im Intron 1 eine Poly-(T) 17 -Region (Abb. 5). Überaschenderweise besaß das murine La/SS-B-Gen zwischen dem Exon 1c und dem Exon 2 kein Intron (Abb. 5). Das humane Gen konnte dagegen zwischen allen Exons ein Intron aufweisen (8.1). In Tabelle 2 sind alle Exon-Intron-Größen des murinen und humanen La/SS-B-Gens detailiert dargestellt.
6 Diskussion 101 A) Humanes La/SS-B-Gen B) Murines La/SS-B-Gen Lage (in bp) Größe (in bp) Lage (in bp) Größe (in bp) Promotor 1 - 239 239 Promotor -527 - -1 527 Exon 1 240 - 396 156 Exon 1a 1 - 86 86 Intron 1 397 - 2328 1931 Intron 1a 87 - 1516 1429 Exon 1’ 397 - 886 489 Exon 1b 1 - 113 113 Intron 1’ 887 - 2328 1441 Intron 1b 114 - 1516 1402 Exon 1’’ 397 - 890 493 Exon 1c 1371 - 1596 225 Intron 1’’ 891 - 2328 1437 Intron 1c - - Exon 2 2329 - 2403 74 Exon 2 1597 - 1690 93 Intron 2 2404 - 4127 1723 Intron 2 1691 - 4561 2870 Exon 3 4128 - 4231 103 Exon 3 4562 - 4664 103 Intron 3 4232 - 4318 86 Intron 3 4665 - 4858 193 Exon 4 4319 - 4493 174 Exon 4 4859 - 5033 174 Intron 4 4494 - 5437 943 Intron 4 5034 - 5642 608 Exon 5 5438 - 5545 107 Exon 5 5643 - 5750 107 Intron 5 5546 - 5623 77 Intron 5 5751 - 5822 71 Exon 6 5624 - 5724 100 Exon 6 5823 - 5923 100 Intron 6 5725 - 7135 1410 Intron 6 5924 - 7073 1149 Exon 7 7136 - 7207 71 Exon 7 7074 - 7145 71 Intron 7 7208 - 7513 305 Intron 7 7146 - 7436 290 Exon 8 7514 - 7556 42 Exon 8 7437 - 7476 39 Intron 8 7557 - 8927 1370 Intron 8 7477 - 8176 699 Exon 9 8928 - 9068 140 Exon 9 8177 - 8317 140 Intron 9 9069 - 9520 451 Intron 9 8318 - 8680 362 Exon 10 9521 - 9848 327 Exon 10 8681 - 9032 351 Intron 10 9849 - 10192 343 Intron 10 9033 - 9319 286 Exon 11 10193 - 10580 387 Exon 11 9320 - 9687 367 3’-UTR 10581 - 10806 288 3’-UTR 9688 - 9982 294 Tabelle 2: Lage und Größe der Exons und Introns im (A) humanen La/SS-B-Gen (GRÖLZ, 1998) und (B) murinen La/SS-B-Gen Die Zahlenangaben beim murinen La/SS-B-Gen beziehen sich auf die komplette Nukleotidsequenz aus Abb. 8, die Zahlenangaben beim humanen La/SS-B-Gen auf die komplette Nukleotidsequenz im Anhang (8.1). Beim Vergleich der Exon-Intron-splice-Nukleotidsequenz-Übergänge ließen sich ab dem Exon 2 des humanen und murinen La/SS-B-Gens große Übereinstimmungen feststellen. Hierbei besaß die 5’-splice-Stelle meist die Basenabfolge AG/GT und die 3’-splice-Stelle meist die Basenabfolge AG/GG. Dagegen wiesen die Sequenz-Übergänge der verschiedenen Exon 1 keinerlei Gemeinsamkeiten auf. Dies konnte nicht weiter verwundern, da die verschiedenen Exon 1 bei der Maus und beim Menschen auch sonst keine Ähnlichkeiten besaßen. Die Sequenzen der Exon-Intron-splice-Übergänge finden sich in Tabelle 3.
Seite 1 und 2:
JOHANNES GUTENBERG-UNIVERSITÄT MAI
Seite 3:
[...] In diesen Zeiten Molekularbio
Seite 6 und 7:
II Verzeichnisse 4.4 Anlegen bakter
Seite 8 und 9:
IV Verzeichnisse II Tabellenverzeic
Seite 10 und 11:
VI Verzeichnisse ELISA enzyme linke
Seite 12 und 13:
VIII Verzeichnisse RNA /m-, ss-, r-
Seite 14 und 15:
X Verzeichnisse BACHMANN, M., HILKE
Seite 16 und 17:
XII Verzeichnisse BJÖRKLUND, S. an
Seite 18 und 19:
XIV Verzeichnisse CHURCH, G. M. and
Seite 20 und 21:
XVI Verzeichnisse GOTTLIEB, E. and
Seite 22 und 23:
XVIII Verzeichnisse KAMINSKI, A., H
Seite 24 und 25:
XX Verzeichnisse LINDER, P., LASKO,
Seite 26 und 27:
XXII Verzeichnisse OLDSTONE, M.B.A.
Seite 28 und 29:
XXIV Verzeichnisse SAIKI, R. K., SC
Seite 30 und 31:
XXVI Verzeichnisse TAN, E.M.: Autoa
Seite 32 und 33:
XXVIII Verzeichnisse WANG, S., BROW
Seite 34 und 35:
2 1 Einleitung variabel mit untersc
Seite 36 und 37:
4 ⇒ 1 Einleitung bei den Autoanti
Seite 38 und 39:
6 1 Einleitung humane La/SS-B-Gen z
Seite 40 und 41:
8 1 Einleitung Lokalisation oder di
Seite 42 und 43:
10 1 Einleitung 1.5.5 Die isoelektr
Seite 44 und 45:
12 1 Einleitung Immuno-Blot denatur
Seite 46 und 47:
14 1 Einleitung BACHMANN et al., 19
Seite 48 und 49:
16 1 Einleitung La/SS-B-Protein spi
Seite 50 und 51:
18 1 Einleitung schwerer Defekte im
Seite 52 und 53:
20 2 Aufgabenstellung Auf Proteineb
Seite 54 und 55:
22 3 Materialien Formaldehyd (deion
Seite 56 und 57:
24 Heizblock Thermomixer 5436 Heizm
Seite 58 und 59:
26 3 Materialien SuperScript TM Pre
Seite 60 und 61:
28 3 Materialien 3.11 Genomische DN
Seite 62 und 63:
30 3 Materialien 3.20 Synthetische
Seite 64 und 65:
32 3 Materialien Primer für den Ge
Seite 66 und 67:
34 4 Methoden 4.5 Schnelle Plasmid-
Seite 68 und 69:
36 4 Methoden Dadurch gelang es, Fr
Seite 70 und 71:
38 4 Methoden 4.13 Verdau von DNA m
Seite 72 und 73:
40 4 Methoden 4.16 Transformation k
Seite 74 und 75:
42 4 Methoden Anlagerungs-Temperatu
Seite 76 und 77:
44 4 Methoden wurde die Lösung mit
Seite 78 und 79:
46 4 Methoden abgesaugt, das Pellet
Seite 80 und 81:
48 4 Methoden Trypsin/EDTA-Lösung
Seite 82 und 83: 50 4 Methoden 4.33 In situ-Hybridis
Seite 84 und 85: 52 4 Methoden 5000 g abzentrifugier
Seite 86 und 87: 54 4 Methoden 4.39 Färbung von SDS
Seite 88 und 89: 56 4 Methoden 4.44 Antikörper-Elut
Seite 90 und 91: 58 4 Methoden abzentrifugiert, der
Seite 93 und 94: 5 Ergebnisse 61 5 ERGEBNISSE A) Unt
Seite 95 und 96: 5 Ergebnisse 63 genome walking durc
Seite 97 und 98: 5 Ergebnisse 65 B) Untersuchung der
Seite 99 und 100: 5 Ergebnisse 67 Mit allen antisense
Seite 101 und 102: 5 Ergebnisse 69 PCR-Produkte des Pr
Seite 103 und 104: 5 Ergebnisse 71 Abb. 9: Nachweis de
Seite 105 und 106: 5 Ergebnisse 73 In Laufspur (D) wur
Seite 107 und 108: 5 Ergebnisse 75 La-Murin-RT-PCR-Rü
Seite 109 und 110: 5 Ergebnisse 77 Proteine aus dem Re
Seite 111 und 112: 5 Ergebnisse 79 30 h nach Beginn de
Seite 113 und 114: 5 Ergebnisse 81 Abb. 14: Klonierung
Seite 115 und 116: 5 Ergebnisse 83 Laufspur 2 ein HeLa
Seite 117 und 118: 5 Ergebnisse 85 umgeschrieben wurde
Seite 119 und 120: 5 Ergebnisse 87 5.9.4 Western-Blott
Seite 121 und 122: 5 Ergebnisse 89 Die Darstellung des
Seite 123 und 124: 5 Ergebnisse 91 allen Laufspuren wa
Seite 125 und 126: 5 Ergebnisse 93 Die in Kulturmedium
Seite 127 und 128: 5 Ergebnisse 95 Fünf Tage nach der
Seite 129: 5 Ergebnisse 97 Färbung bestätigt
Seite 134 und 135: 102 6 Diskussion A) Sequenzen der E
Seite 136 und 137: 104 6 Diskussion sich auch Bindeste
Seite 138 und 139: 106 6 Diskussion Ebenso ließen sic
Seite 140 und 141: 108 6 Diskussion 6.7 Vergleich der
Seite 142 und 143: 110 6 Diskussion Polyadenylierungss
Seite 144 und 145: 112 6 Diskussion gab. Von großem I
Seite 146 und 147: 114 6 Diskussion 6.13 Ubiqitäre un
Seite 148 und 149: 116 6 Diskussion Exon 1b-mRNA-Isofo
Seite 150 und 151: 118 6 Diskussion La/SS-B-Proteinmen
Seite 152 und 153: 120 6 Diskussion Bei mRNAs mit lang
Seite 154 und 155: 122 6 Diskussion Translationsinitia
Seite 156 und 157: 124 6 Diskussion Translation diente
Seite 158 und 159: 126 6 Diskussion 6.17 Die Lokalisat
Seite 160 und 161: 128 6 Diskussion 6.18.4 Die linker-
Seite 162 und 163: 130 6 Diskussion und rek. Proteinen
Seite 164 und 165: 132 6 Diskussion dessen Einfluß au
Seite 166 und 167: 134 6 Diskussion spreading könnte
Seite 168 und 169: 136 6 Diskussion werden konnte. Sic
Seite 170 und 171: 138 7 Zusammenfassung Polyadenylier
Seite 172 und 173: 140 8 Anhang 4701 TGCAGTCTTGACCTCCT
Seite 174 und 175: 142 8 Anhang 4101 TGCCTCAGAGTCCTAAA
Seite 176 und 177: 144 8 Anhang 449 CAAATGAGAAGAACATTA
Seite 178 und 179: 146
Alle anzeigen

verzeichnisse - ArchiMeD - Johannes Gutenberg-Universität Mainz

Erfolgreiche ePaper selbst erstellen

Template löschen?

Als Template speichern?