verzeichnisse - ArchiMeD - Johannes Gutenberg-Universität Mainz
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8 Anhang 141<br />
8.2 Lage der Primer im murinen La/SS-B-Gen<br />
In der folgenden Sequenz des murinen La/SS-B-Gens sind alle Primer enthalten, die für PCR mit<br />
genomischer DNA oder für das genome walking verwendet werden. Vorwärtsprimer sind durch (→),<br />
Rückwärtsprimer durch (←) gekennzeichnet. Alle Rückwärtsprimer tragen außerdem den Zusatz „-R“<br />
oder „-Rück“. Alle Exons sind umrandet. Fett dargestellt sind das Start-AUG im Exon 2, die 9A-Kassette<br />
im Exon 7, das Start-AUG zu Beginn der C-terminalen Proteinhälfte (M223) im Exon 9 und das<br />
Stop-Codon im Exon 11. Die Sequenz beginnt mit dem Exon 1a bzw. Exon 1b. Im ersten Exon ist die<br />
Sequenz unterstrichen, um die das Exon 1b im Vergleich zum Exon 1a verlängert ist. Da sich das Exon 1c<br />
direkt vor dem Exon 2 befindet, ist das Exon 1c zusätzlich durch Unterstreichung gekennzeichnet. Die<br />
Lage und Größe der Exons und Introns des murinen La/SS-B-Gens finden sich in Tabelle 2.<br />
La-Murin-<br />
1 TGCTGTCGGGCCCGCCGGCGCTCGGAAGTCCAGGCGCTTCTGTCGTTGTTCTTGAAGCTGTGGTGACCGTGGGATCCGAATCTTTGAGGTGAGCTTCTTG 100<br />
-P1R (←)<br />
101 GAGACTGAGGAGAAGGTACGAAGGGCTGTGCTATGCGCAGGCCTCACCTTCCTCTCCGCGCCGCCGCGTGGGCCGCGCGGCCCGTGGCCGTGTGCTGGAC 200<br />
201 CGCGGCCCGAGGGGGCGCGGGCCTCGGCGAGGCCACGGAGCGGGCCCCGGCCAGAGATGCGGGCGCCTGGGGCTTTCCACGTGGCAGGGATCCCGGCGGG 300<br />
301 CCGGTGTGGGAGGATGCGGCTCTCGCGGGGCCTTTAGGCAGAGGCTCGCCGCATCCTCACGGCGTCCTTTCGGTTTGTTCCTTGCACCCCTTTCCTGACT 400<br />
401 GGCCAGAGGCGGATGTTTCGGACCATTTAAGTCTTTAGGGTGGTCGGTGCGGGTTAAACGCGACAGGGTTCTGTGGGGACTGACTGGAGGCCGAAGAAGT 500<br />
501 GGGGGCCGCTATTGGGTTCCCAGCGTCGCTATCTTTTTTTTTTTTTTTTTCCTTCAAAGAACTGCCATTGCCATTCTGTCTTCAGTGTGAAACAGTCCCT 600<br />
601 AAATTGGGTAGGCCGCAGAAGTCTTGCAGGGGCTAACTAGGTCGGTATTGACCTGTGTCTCTGTAGTAATGAGAAGTGAGATTGTTGGTAGTGGGAGACA 700<br />
701 AACCAGCGCCTGTAACAGTAAATTCTGAAGTGGGACGTGTACTTCGTAGATTTCCCATTACAGGACCAGTGTATCGCCAGCAGTCTCCAGCATTTTGAGC 800<br />
GWK-In1-R5 (←)<br />
801 AATGTCTCAAGAAATATACCAACAGTAACTCATAACTATATTCAGCTGCTGCAGATAAACTCTTCAAGAGCTGGTATACTTCCGTACAATATGGTAGGGT 900<br />
901 GGTTTAGTAAGGCGCTGGAAGCCAGTAAGACAGAAGATCCGGTTTGTGATTTCTAGCAAACCAGTATCACAGTCCCTCTTTATTCTAGGATTGCTGTCAG 1000<br />
1001 ACCGTGAAACAGGAAAGTGGCTATAGAGTTAACCAGTGTAGTAGTGTTTTAGGCACATCCTTACCTTCCAGCGTCCCTAGTTTAAAATTTTTTGTATCTG 1100<br />
1101 TGCTCACAAGGTCCCATTTTTCTTGTATTCTCCTATATAGTGTCTAACACCGTAACTTTCATATCTGAACTCTATTTTCATTTTTACCAGTAATAAGTTT 1200<br />
1201 TGGTAAGTCAGCTGTGACTAATTTTGAAAAGAAACGCAAATAATTGGCATTGAGGGCTATAGGAATATACTGCTGGCAGACTATAATACTGATATTTTTA 1300<br />
GWK-In1-R2-nested (←)<br />
1301 AAGCTAGGAATGATTGAGGGGTAGTTAAGTGGACATTTTCTGCTTTTTTGTTTTTATCGCTGAACTTTGCTTTACCAACTACATGAAGAGTTTGGTTACA 1400<br />
GWK-In1-R1A (←)<br />
1401 AAGTAGGATTTACTGGGAGGAGGGGTTGTTGATCTGAGTTTTCCATCCATAATCCAAGGTGTTGCTTTGTTGAGATGTATGAGAATTCATAGGGAAACCT 1500<br />
Maus-mRNA-F3 (→)<br />
1501 GTAAGGTTAGGAATTCTTGAAATTAAAAAAAAAGTGGCATACTTTTTACTCATTCTCTTGTATTGACTATTATATAAAAATAATAACCTTCCTACCAGTG 1600<br />
La-Murin-P2 (→)<br />
1601 TGAGAAACTTTACAGATAGCCACAATGGCTGAAAATGGAGATAATGAAAAAATGACTGCTTTGGAGGCCAAAATCTGTCATCAAATTGAGGTATGATTCT 1700<br />
GWK-In2-R4-nested (←)<br />
1701 TGTGTGGTTAAATTGTAACTTAAGATGAAAACAGAACATCTAATAGCGATATGTGGGCTTTTCAAACAACTGGCTTAGCTTTGATTCTTGGAGTTAATAT 1800<br />
1801 GAATGTATTCATATTAGGGCAAAGTTAGAAGTCTCAAGAATTACAGACATTCCAAAGGTAACACTGTAGACTGGTGTTTATTTTTGAGACACAGAGTTCT 1900<br />
GWK-In2-R3 (←)<br />
1901 CAAGTCTGTAAAATGGAGGTAATATTTGTCAGTTGATGTGAAAATTAATGGTGTGCCTAATATCTAACAAGCTAGCATAAATTCCATGGTAAAGTACTTC 2000<br />
2001 TGGTCAAATAATAGTTTATTCTATCTAGTTAGTTCTCTTCTAAAAAGTTAACATAACTTTTTAACAAATTATGCATTTCAAAAGTCCTGTTAGACTGTTC 2100<br />
2101 TCCACTTCTCTCTCTGCGTGCACTTAGCCCCTTCTCTCTTTCTCTCTTTTCTGCCCCACTTCCCCATGGAGACTTCCCTGGCCTTCATCCTTGGGGCCAG 2200<br />
2201 TGATCTTGCCCATCTAAGATCAGCTTCCCAATAAACCTGCATTTAATATAATCTTAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAAATAACAAAAGTCCTGTTAGCAT 2300<br />
La-Murin-In2-F1 (→)<br />
2301 TTCAAATTTAGGTTTAGATGGAATGTTGTCAGTAACAGAATGGCTGTGGGGAAATTGCCCATAAATTGCTTTTATGCCATGAAATAACCATTGGTTAGTG 2400<br />
GWK-In2-R1 (←)<br />
CTTGTACGTGTGTTGTCATGGA<br />
2401 TGTGTGCTCTTTTTTTTCCATTTCTTAGCTGTTTTGGTTTTGTTTTAACTTGTACACCTTTGTCCTTTAAATTGTCCTGCTTTTATTTTTCGTTTCTCAT 2500<br />
2501 ATTTTCCCCCTTCTGAGTAATGGAGATCAAACTCAAGGCATGCTAGGCAGTCACTCAGTGAGCTGTAGGCATTTGCGGCTACAAATGTTGTCTGATTTTT 2600<br />
2601 TTAAAAAATTATTTATTTTTATGTGCATTGGTGTTTTGTCTGCATGTATGTCTGTGTGAAGGATCCCCCGGAACTAGAGTTACAGACAGTTGTGAGCTTC 2700<br />
2701 TATGTGGATGCCAAGAATTGAACCTGGGTCCTCCGGAAGAGCAGCTAGTTCTTTTAACTGCTGAACCATCTCCAGCCCCTTTTGTTTGATTGGGGGAAAA 2800<br />
2801 AATTGTGTTTTCTTAATAATTGCAAAAGCAGTGATAAGATAATTTGCTGTTTAATGCTTGGAACAATAGCAAATTTGTTATAGAAAAGAATAATGTTCCT 2900<br />
2901 CCCACAGCCTGCAGCCTCACATCTCTCCCTCTTGAGATATTCAAGGTTAAAAGCCTTTTCATACTCCATGTTCAAAATACATTTTATTTTTAGTGTACTT 3000<br />
3001 TATGTGTATGGATGTTATGTCTACATGTATGGCTGTGTGCCGTGTACATGCCTGGGTGCCCTCAGAAGCCAGAAGTGTGCACTGGCTCCCCTAGGACTGG 3100<br />
3101 AATAACAGATGGGTATAAGGCCCCTAATGGAAGTGCCGGGAATTGAATCTGGTCACCATTCAGTGCTCTTAACCTCTGAGTCATCTCTCCAGCTCCTAAA 3200<br />
3201 TATTTTTTTTTAAAGGAGGCCCAATTTTTTTATTTTTTTAAAGAATATAAAGTTCAAGTAAAACTACTCAGAGACAAGATTTCCTAAACATCCCCAACCA 3300<br />
3301 GGATGGCCTATAAACTTAATTTTTATTTTTTCCTTTTCCCCCACCAAACATGAGATGTTTTTAGAGAGTAAAGTTTTGTTTCACCAACAATATATAATTA 3400<br />
3401 ATAATCATCTTCTCTAAAGTATAGATTTTTAAAAATATGAGTTCTACGATATTCTTTATGTAAAAATTTTAGTAAACAGGTCTACTGCTTGCCTTCTCCC 3500<br />
3501 TCTCGTTCCTCTCCTCCCTCCTTTTTCTCTTTTACTTTTTTCCTTCCTTTTATCCATCCATTCATCTCATGCATCCAGGGCTGTCCTGGGGAAAATTCAC 3600<br />
3601 AAACTCATAGAGGTAGATCACCTTGCTTCTGCTTCCCATGTGTGAGAATTAAAGAGCATGAGCCATCACATCTACCTTATTTTAAAAAATAGTGTGTGTC 3700<br />
3701 TGTGTCTGTCTGCATATCAATATTTGGCCCTCAGAGGTGTCATCCTCTGGAGCTGTAGTTACAGTCTCTTATGAGCCAACTGACAAGCCTGTAAGAACCT 3800<br />
La-Murin-<br />
3801 ACCTCAGGTCTTCTGGAAGAGCAGCAGCATTCTTAGGCATTGAGCCATCCTCTAGCTCTCCTGCTGATTTCTTTAAGATGGAATTCCTAGGAGGAGCTAC 3900<br />
In2-R1 (←)<br />
3901 ATTGATTGGCTCAAGCTAGTGCTGAGATTGAAGGCATCTTAGGTTTTGATTAGTAATGATACTAGATTTTTTTGTGTTTGTGGTGTGTGTTTATATAATT 4000<br />
4001 TTTAAAGGTGGCTGGGTATGGTGGTACCTAATTTTAATCCTAGGACCTTGGAAAGTAGAGGCAGGTGGATCTCTTGACTTTGAGAACTTAGAAGAAATTC 4100