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verzeichnisse - ArchiMeD - Johannes Gutenberg-Universität Mainz

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8 Anhang 141<br />

8.2 Lage der Primer im murinen La/SS-B-Gen<br />

In der folgenden Sequenz des murinen La/SS-B-Gens sind alle Primer enthalten, die für PCR mit<br />

genomischer DNA oder für das genome walking verwendet werden. Vorwärtsprimer sind durch (→),<br />

Rückwärtsprimer durch (←) gekennzeichnet. Alle Rückwärtsprimer tragen außerdem den Zusatz „-R“<br />

oder „-Rück“. Alle Exons sind umrandet. Fett dargestellt sind das Start-AUG im Exon 2, die 9A-Kassette<br />

im Exon 7, das Start-AUG zu Beginn der C-terminalen Proteinhälfte (M223) im Exon 9 und das<br />

Stop-Codon im Exon 11. Die Sequenz beginnt mit dem Exon 1a bzw. Exon 1b. Im ersten Exon ist die<br />

Sequenz unterstrichen, um die das Exon 1b im Vergleich zum Exon 1a verlängert ist. Da sich das Exon 1c<br />

direkt vor dem Exon 2 befindet, ist das Exon 1c zusätzlich durch Unterstreichung gekennzeichnet. Die<br />

Lage und Größe der Exons und Introns des murinen La/SS-B-Gens finden sich in Tabelle 2.<br />

La-Murin-<br />

1 TGCTGTCGGGCCCGCCGGCGCTCGGAAGTCCAGGCGCTTCTGTCGTTGTTCTTGAAGCTGTGGTGACCGTGGGATCCGAATCTTTGAGGTGAGCTTCTTG 100<br />

-P1R (←)<br />

101 GAGACTGAGGAGAAGGTACGAAGGGCTGTGCTATGCGCAGGCCTCACCTTCCTCTCCGCGCCGCCGCGTGGGCCGCGCGGCCCGTGGCCGTGTGCTGGAC 200<br />

201 CGCGGCCCGAGGGGGCGCGGGCCTCGGCGAGGCCACGGAGCGGGCCCCGGCCAGAGATGCGGGCGCCTGGGGCTTTCCACGTGGCAGGGATCCCGGCGGG 300<br />

301 CCGGTGTGGGAGGATGCGGCTCTCGCGGGGCCTTTAGGCAGAGGCTCGCCGCATCCTCACGGCGTCCTTTCGGTTTGTTCCTTGCACCCCTTTCCTGACT 400<br />

401 GGCCAGAGGCGGATGTTTCGGACCATTTAAGTCTTTAGGGTGGTCGGTGCGGGTTAAACGCGACAGGGTTCTGTGGGGACTGACTGGAGGCCGAAGAAGT 500<br />

501 GGGGGCCGCTATTGGGTTCCCAGCGTCGCTATCTTTTTTTTTTTTTTTTTCCTTCAAAGAACTGCCATTGCCATTCTGTCTTCAGTGTGAAACAGTCCCT 600<br />

601 AAATTGGGTAGGCCGCAGAAGTCTTGCAGGGGCTAACTAGGTCGGTATTGACCTGTGTCTCTGTAGTAATGAGAAGTGAGATTGTTGGTAGTGGGAGACA 700<br />

701 AACCAGCGCCTGTAACAGTAAATTCTGAAGTGGGACGTGTACTTCGTAGATTTCCCATTACAGGACCAGTGTATCGCCAGCAGTCTCCAGCATTTTGAGC 800<br />

GWK-In1-R5 (←)<br />

801 AATGTCTCAAGAAATATACCAACAGTAACTCATAACTATATTCAGCTGCTGCAGATAAACTCTTCAAGAGCTGGTATACTTCCGTACAATATGGTAGGGT 900<br />

901 GGTTTAGTAAGGCGCTGGAAGCCAGTAAGACAGAAGATCCGGTTTGTGATTTCTAGCAAACCAGTATCACAGTCCCTCTTTATTCTAGGATTGCTGTCAG 1000<br />

1001 ACCGTGAAACAGGAAAGTGGCTATAGAGTTAACCAGTGTAGTAGTGTTTTAGGCACATCCTTACCTTCCAGCGTCCCTAGTTTAAAATTTTTTGTATCTG 1100<br />

1101 TGCTCACAAGGTCCCATTTTTCTTGTATTCTCCTATATAGTGTCTAACACCGTAACTTTCATATCTGAACTCTATTTTCATTTTTACCAGTAATAAGTTT 1200<br />

1201 TGGTAAGTCAGCTGTGACTAATTTTGAAAAGAAACGCAAATAATTGGCATTGAGGGCTATAGGAATATACTGCTGGCAGACTATAATACTGATATTTTTA 1300<br />

GWK-In1-R2-nested (←)<br />

1301 AAGCTAGGAATGATTGAGGGGTAGTTAAGTGGACATTTTCTGCTTTTTTGTTTTTATCGCTGAACTTTGCTTTACCAACTACATGAAGAGTTTGGTTACA 1400<br />

GWK-In1-R1A (←)<br />

1401 AAGTAGGATTTACTGGGAGGAGGGGTTGTTGATCTGAGTTTTCCATCCATAATCCAAGGTGTTGCTTTGTTGAGATGTATGAGAATTCATAGGGAAACCT 1500<br />

Maus-mRNA-F3 (→)<br />

1501 GTAAGGTTAGGAATTCTTGAAATTAAAAAAAAAGTGGCATACTTTTTACTCATTCTCTTGTATTGACTATTATATAAAAATAATAACCTTCCTACCAGTG 1600<br />

La-Murin-P2 (→)<br />

1601 TGAGAAACTTTACAGATAGCCACAATGGCTGAAAATGGAGATAATGAAAAAATGACTGCTTTGGAGGCCAAAATCTGTCATCAAATTGAGGTATGATTCT 1700<br />

GWK-In2-R4-nested (←)<br />

1701 TGTGTGGTTAAATTGTAACTTAAGATGAAAACAGAACATCTAATAGCGATATGTGGGCTTTTCAAACAACTGGCTTAGCTTTGATTCTTGGAGTTAATAT 1800<br />

1801 GAATGTATTCATATTAGGGCAAAGTTAGAAGTCTCAAGAATTACAGACATTCCAAAGGTAACACTGTAGACTGGTGTTTATTTTTGAGACACAGAGTTCT 1900<br />

GWK-In2-R3 (←)<br />

1901 CAAGTCTGTAAAATGGAGGTAATATTTGTCAGTTGATGTGAAAATTAATGGTGTGCCTAATATCTAACAAGCTAGCATAAATTCCATGGTAAAGTACTTC 2000<br />

2001 TGGTCAAATAATAGTTTATTCTATCTAGTTAGTTCTCTTCTAAAAAGTTAACATAACTTTTTAACAAATTATGCATTTCAAAAGTCCTGTTAGACTGTTC 2100<br />

2101 TCCACTTCTCTCTCTGCGTGCACTTAGCCCCTTCTCTCTTTCTCTCTTTTCTGCCCCACTTCCCCATGGAGACTTCCCTGGCCTTCATCCTTGGGGCCAG 2200<br />

2201 TGATCTTGCCCATCTAAGATCAGCTTCCCAATAAACCTGCATTTAATATAATCTTAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAAATAACAAAAGTCCTGTTAGCAT 2300<br />

La-Murin-In2-F1 (→)<br />

2301 TTCAAATTTAGGTTTAGATGGAATGTTGTCAGTAACAGAATGGCTGTGGGGAAATTGCCCATAAATTGCTTTTATGCCATGAAATAACCATTGGTTAGTG 2400<br />

GWK-In2-R1 (←)<br />

CTTGTACGTGTGTTGTCATGGA<br />

2401 TGTGTGCTCTTTTTTTTCCATTTCTTAGCTGTTTTGGTTTTGTTTTAACTTGTACACCTTTGTCCTTTAAATTGTCCTGCTTTTATTTTTCGTTTCTCAT 2500<br />

2501 ATTTTCCCCCTTCTGAGTAATGGAGATCAAACTCAAGGCATGCTAGGCAGTCACTCAGTGAGCTGTAGGCATTTGCGGCTACAAATGTTGTCTGATTTTT 2600<br />

2601 TTAAAAAATTATTTATTTTTATGTGCATTGGTGTTTTGTCTGCATGTATGTCTGTGTGAAGGATCCCCCGGAACTAGAGTTACAGACAGTTGTGAGCTTC 2700<br />

2701 TATGTGGATGCCAAGAATTGAACCTGGGTCCTCCGGAAGAGCAGCTAGTTCTTTTAACTGCTGAACCATCTCCAGCCCCTTTTGTTTGATTGGGGGAAAA 2800<br />

2801 AATTGTGTTTTCTTAATAATTGCAAAAGCAGTGATAAGATAATTTGCTGTTTAATGCTTGGAACAATAGCAAATTTGTTATAGAAAAGAATAATGTTCCT 2900<br />

2901 CCCACAGCCTGCAGCCTCACATCTCTCCCTCTTGAGATATTCAAGGTTAAAAGCCTTTTCATACTCCATGTTCAAAATACATTTTATTTTTAGTGTACTT 3000<br />

3001 TATGTGTATGGATGTTATGTCTACATGTATGGCTGTGTGCCGTGTACATGCCTGGGTGCCCTCAGAAGCCAGAAGTGTGCACTGGCTCCCCTAGGACTGG 3100<br />

3101 AATAACAGATGGGTATAAGGCCCCTAATGGAAGTGCCGGGAATTGAATCTGGTCACCATTCAGTGCTCTTAACCTCTGAGTCATCTCTCCAGCTCCTAAA 3200<br />

3201 TATTTTTTTTTAAAGGAGGCCCAATTTTTTTATTTTTTTAAAGAATATAAAGTTCAAGTAAAACTACTCAGAGACAAGATTTCCTAAACATCCCCAACCA 3300<br />

3301 GGATGGCCTATAAACTTAATTTTTATTTTTTCCTTTTCCCCCACCAAACATGAGATGTTTTTAGAGAGTAAAGTTTTGTTTCACCAACAATATATAATTA 3400<br />

3401 ATAATCATCTTCTCTAAAGTATAGATTTTTAAAAATATGAGTTCTACGATATTCTTTATGTAAAAATTTTAGTAAACAGGTCTACTGCTTGCCTTCTCCC 3500<br />

3501 TCTCGTTCCTCTCCTCCCTCCTTTTTCTCTTTTACTTTTTTCCTTCCTTTTATCCATCCATTCATCTCATGCATCCAGGGCTGTCCTGGGGAAAATTCAC 3600<br />

3601 AAACTCATAGAGGTAGATCACCTTGCTTCTGCTTCCCATGTGTGAGAATTAAAGAGCATGAGCCATCACATCTACCTTATTTTAAAAAATAGTGTGTGTC 3700<br />

3701 TGTGTCTGTCTGCATATCAATATTTGGCCCTCAGAGGTGTCATCCTCTGGAGCTGTAGTTACAGTCTCTTATGAGCCAACTGACAAGCCTGTAAGAACCT 3800<br />

La-Murin-<br />

3801 ACCTCAGGTCTTCTGGAAGAGCAGCAGCATTCTTAGGCATTGAGCCATCCTCTAGCTCTCCTGCTGATTTCTTTAAGATGGAATTCCTAGGAGGAGCTAC 3900<br />

In2-R1 (←)<br />

3901 ATTGATTGGCTCAAGCTAGTGCTGAGATTGAAGGCATCTTAGGTTTTGATTAGTAATGATACTAGATTTTTTTGTGTTTGTGGTGTGTGTTTATATAATT 4000<br />

4001 TTTAAAGGTGGCTGGGTATGGTGGTACCTAATTTTAATCCTAGGACCTTGGAAAGTAGAGGCAGGTGGATCTCTTGACTTTGAGAACTTAGAAGAAATTC 4100

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