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Literaturübersicht 25
2.4 Anwendungsmöglichkeiten der molekulargenetischen Marker
2.4.1 Molekulargenetische Marker
Als molekulare Marker bezeichnet man ganz allgemein Abschnitte eines Chromosoms,
die in einer Population in verschiedenen Varianten (Allelen) vorkommen. Die
molekulargenetischen Marker sind dadurch gekennzeichnet, dass sich ihre
Polymorphismen mit molekulargenetischen Methoden auf dem Niveau der DNA
darstellen lassen (HARDGE, 1999). Die dominierenden genetischen Marker in der
Nutztierzucht sind DNA Marker. Allgemein wird zwischen Typ I- und Typ II- Markern
unterschieden. Während die Typ I-Marker Polymorphismen repräsentieren, die direkt in
Genen lokalisiert sind, stellen Typ II-Marker Sequenzvariationen in nichtkodierender
DNA dar (HAMANN, 1995). Nach VAN der WERF et al. (2003) ist das einfachste
Szenario bei einem direkten Marker, wenn das Markerallele M und das QTL-Allele Q
immer gemeinsam vorliegen. Solche direkten Marker sind sehr bequem, da der Marker-
Genotyp uns direkt über den QTL-Genotyp informiert. Allerdings gibt es zur Zeit nur
einige direkte genetische Marker für Merkmale, die von wirtschaftlicher Bedeutung
sind. Als Beispiel dafür wäre das MHS-Gen beim Schwein und das Doppellendergen
beim Rind zu nennen. Nach DEKKERS et al. (2002) werden zwei Ansätze zur Erkennung
von indirekten Markern verwendet: zum einen die gezielte Suche mit Hilfe von
Kandidatgenen in einer unstrukturierten Population und zum anderen genomweite
Suche in Spezialpopulationen wie z.B. F2-Kreuzung. Diese zunächst unbekannten
Genorte bezeichnet man als quantitative trait loci (QTL), wenn sie einen größeren
Beitrag zur Ausprägung eines polygen bedingten Merkmales leisten. Bei der marker
assisted selection (MAS) geht es darum, QTLS mit Hilfe gekoppelter Marker so schnell
wie möglich in einer Population zu fixieren.
Nach WEIGEND (2002) weisen VNTRs (Variable Number Tandem Repeat) einen Typus
von DNA-Sequenzen auf, die auf einer variierenden Anzahl sich wiederholender DNA
Segmente sowie Sequenzunterschieden in den flankierenden Regionen dieser Genorte
beruhen. Je nach Größe der Wiederholungseinheiten unterscheidet man zwischen Miniund
Mikrosatelliten. Ist die Wiederholungseinheit kleiner als vier Basenpaare, so wird
der VNTR Mikrosatellit genannt. Ist die sich wiederholende Einheit länger, so handelt
es sich um einen Minisatellit (VAN der WERF, 2000). Mikrosatelliten können mit wenig