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Literaturübersicht 29
Genom von Hühnern nur wenige RFLPs beschrieben. Bei einer Genomgröße von 2x10 9
sind 2x10 7 polymorphe Basenpaare im Genom des Huhnes vorhanden.
Random amplified polymorphic DNA (RAPD) bezeichnet ein Verfahren zur
Amplikation unbekannter DNA-Sequenzen in einem zyklischen In-vitro-Amplikations-
Prozess –entsprechend einer PCR– mit einem Primer aus zufälligen Nukleotidsequenzen.
Nach WIMMERS (1994) wurde RAPD von LEVIN et al. (1993) zur
Konstruktion einer genetischen Karte des Z-Chromosoms beim Huhn eingesetzt. Sie
benutzten 298 Primer mit 60 bis 80% G+C-Gehalt zur Untersuchung von Individuen
einer White-Leghorn-Inzuchtlinie und einer Red-Jungle-Fowl-Inzuchtlinie sowie deren
F1- und Rückkreuzungsgeneration. Dabei konnten 13 auf dem Z-Chromosom der
White-Leghorn-Linie lokalisierte RAPD-Fragmente identifiziert und kartiert werden.
RAPD-Marker sind zwar zur Kartierung geeignet, aber aufgrund ihres dominanten
Vererbungsmodus der Allele sind sie für bestimmte Anwendungen nicht besonders
informativ (AJMONE-MARSAN et al., 1997).
Seit neuster Zeit gehören SNPs (single nucleotide polymorphisms) zu den wichtigsten
molekularen Markern. Die potentielle Anzahl von SNP Markern ist sehr hoch, d.h., dass
sie in allen Bereichen des Genoms gefunden werden und dass mit Hilfe von micro-array
Verfahren hunderte von SNP-Loci gleichzeitig und automatisch bei geringen Kosten
pro Probe gezählt werden können (FAO, 2003). Nach SCHLÖTTERER (2004) liegt der
große Vorteil von SNPs im hohen Potential der Automatisierung bei angemessenen
Kosten. SNPS sind sowohl für die Feinkartierung als auch für die Kopplungsungleichgewichtskartierung
von komplexen Merkmalen geeignet. Allerdings ist der
Informationsgehalt einzelner SNPs begrenzt, vor allem wenn eins der beiden Allele mit
geringer Frequenz vorkommt.